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Mechanisms underlying regulation and removal of G-quadruplex/R-loop transcription-replication conflicts

Descripción del proyecto

Comprender cómo falla la resolución de errores en el genoma en algunas enfermedades

La transcripción (síntesis del ARN a partir del ADN) y la replicación (síntesis de una copia idéntica del ADN a partir del ADN existente) son procesos comunes en la célula. Estos procesos utilizan el mismo «molde» de ADN, pero pueden desplazarse a través de él en diferentes direcciones y a diferentes velocidades. Los encuentros o las colisiones pueden provocar conflictos entre la transcripción y la replicación (TRC, por sus siglas en inglés), daños en el ADN e inestabilidad genómica. Una de las razones que subyace a estos TRC es la existencia de cuádruples de guanina (G4, estructuras secundarias de ADN) e híbridos de ARN-ADN (bucles R, o R-loops por sus siglas en inglés), que pueden suponer un obstáculo al avance de la horquilla de replicación. Las células han desarrollado estrategias para resolver estos TRC, pero se desconocen en gran medida los mecanismos por los que las células responden a los TRC inducidos por los bucles R/G4. El proyecto GLoopID, financiado con fondos europeos, utiliza técnicas novedosas para responder a preguntas sin resolver con posible aplicación en tratamientos dirigidos para enfermedades como el cáncer y algunos trastornos genéticos.

Objetivo

Maintenance of genome stability is challenged by obstacles that interfere with normal progression of essential DNA-associated transactions, such as DNA replication and transcription. One such obstacle is the G-quadruplex (G4) DNA secondary structure, which can form in G-rich repetitive DNA sequences. Transcribed G4-DNA loci often co-exist with stable RNA-DNA hybrids (R-loops), potentially causing deleterious transcription-replication conflicts (TRCs). Therefore, the ability of cells to mitigate TRCs formation is critical for cell and organismal fitness. While the pathways involved in repairing other DNA lesions are relatively well understood, the mechanisms by which cells respond to G4/R-loop-induced TRCs remain uncharted, largely due to a lack of efficient approaches for inducing site-specific G4s/R-loops into the genome. Several studies reported dedicated helicases capable of unwinding G4s/R-loops, yet whether additional factors exist and how different types of TRCs are resolved remains unknown. In this project, I aim to dissect the fundamental mechanisms that protect cells from TRCs at DNA loci harbouring G4s/R-loops. To do so, I will establish a novel system with site-specific G4/R-loop substrates in living cells and I will systematically investigate their protein composition to identify novel factors in G4/R-loop metabolism. I will further examine the genetic vulnerabilities of candidate G4/R-loop helicase-deficient cells and the regulatory mechanisms underlying G4/R-loop unwinding by these helicases. As mutations in several G4/R-loop helicases predispose to various cancers and genetic disorders, a detailed understanding of the basic mechanisms controlling G4/R-loop removal is of utmost importance, and will shed light on disease aetiology and the rational development of more targeted therapeutic strategies.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2019

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 224 933,76
Dirección
1 MIDLAND ROAD
NW1 1AT London
Reino Unido

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Región
London Inner London — West Camden and City of London
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 224 933,76
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