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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Mechanisms underlying regulation and removal of G-quadruplex/R-loop transcription-replication conflicts

Description du projet

Comprendre comment la résolution des conflits dans le génome échoue pour certaines maladies

La transcription (création d’ARN à partir du code ADN) et la réplication (création d’une copie d’ADN à partir de l’ADN existant) sont des phénomènes fréquents dans les cellules. Elles utilisent la même «matrice» d’ADN, mais les processus peuvent se dérouler dans des directions et à des rythmes différents. Des rencontres ou des collisions peuvent provoquer des conflits de transcription-réplication (CTR), une lésion de l’ADN et une instabilité génomique. L’une des causes de ces CTR est l’existence de quadruplexes G (G4, structures secondaires de l’ADN) et d’hybrides ARN-ADN (boucles R), qui peuvent constituer un obstacle à la progression de la fourchette de réplication. Les cellules ont développé des stratégies pour résoudre ces CRT, mais les mécanismes par lesquels les cellules répondent aux CRT induits par les boucles G4/R sont encore largement inconnus. Le projet GLoopID, financé par l’UE, utilisera de nouvelles techniques pour répondre à des questions ouvertes qui pourraient être appliquées à des thérapies ciblées pour des maladies telles que le cancer et certains troubles génétiques.

Objectif

Maintenance of genome stability is challenged by obstacles that interfere with normal progression of essential DNA-associated transactions, such as DNA replication and transcription. One such obstacle is the G-quadruplex (G4) DNA secondary structure, which can form in G-rich repetitive DNA sequences. Transcribed G4-DNA loci often co-exist with stable RNA-DNA hybrids (R-loops), potentially causing deleterious transcription-replication conflicts (TRCs). Therefore, the ability of cells to mitigate TRCs formation is critical for cell and organismal fitness. While the pathways involved in repairing other DNA lesions are relatively well understood, the mechanisms by which cells respond to G4/R-loop-induced TRCs remain uncharted, largely due to a lack of efficient approaches for inducing site-specific G4s/R-loops into the genome. Several studies reported dedicated helicases capable of unwinding G4s/R-loops, yet whether additional factors exist and how different types of TRCs are resolved remains unknown. In this project, I aim to dissect the fundamental mechanisms that protect cells from TRCs at DNA loci harbouring G4s/R-loops. To do so, I will establish a novel system with site-specific G4/R-loop substrates in living cells and I will systematically investigate their protein composition to identify novel factors in G4/R-loop metabolism. I will further examine the genetic vulnerabilities of candidate G4/R-loop helicase-deficient cells and the regulatory mechanisms underlying G4/R-loop unwinding by these helicases. As mutations in several G4/R-loop helicases predispose to various cancers and genetic disorders, a detailed understanding of the basic mechanisms controlling G4/R-loop removal is of utmost importance, and will shed light on disease aetiology and the rational development of more targeted therapeutic strategies.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 224 933,76
Adresse
1 MIDLAND ROAD
NW1 1AT London
Royaume-Uni

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Région
London Inner London — West Camden and City of London
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 224 933,76
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