Description du projet
Comprendre comment la résolution des conflits dans le génome échoue pour certaines maladies
La transcription (création d’ARN à partir du code ADN) et la réplication (création d’une copie d’ADN à partir de l’ADN existant) sont des phénomènes fréquents dans les cellules. Elles utilisent la même «matrice» d’ADN, mais les processus peuvent se dérouler dans des directions et à des rythmes différents. Des rencontres ou des collisions peuvent provoquer des conflits de transcription-réplication (CTR), une lésion de l’ADN et une instabilité génomique. L’une des causes de ces CTR est l’existence de quadruplexes G (G4, structures secondaires de l’ADN) et d’hybrides ARN-ADN (boucles R), qui peuvent constituer un obstacle à la progression de la fourchette de réplication. Les cellules ont développé des stratégies pour résoudre ces CRT, mais les mécanismes par lesquels les cellules répondent aux CRT induits par les boucles G4/R sont encore largement inconnus. Le projet GLoopID, financé par l’UE, utilisera de nouvelles techniques pour répondre à des questions ouvertes qui pourraient être appliquées à des thérapies ciblées pour des maladies telles que le cancer et certains troubles génétiques.
Objectif
Maintenance of genome stability is challenged by obstacles that interfere with normal progression of essential DNA-associated transactions, such as DNA replication and transcription. One such obstacle is the G-quadruplex (G4) DNA secondary structure, which can form in G-rich repetitive DNA sequences. Transcribed G4-DNA loci often co-exist with stable RNA-DNA hybrids (R-loops), potentially causing deleterious transcription-replication conflicts (TRCs). Therefore, the ability of cells to mitigate TRCs formation is critical for cell and organismal fitness. While the pathways involved in repairing other DNA lesions are relatively well understood, the mechanisms by which cells respond to G4/R-loop-induced TRCs remain uncharted, largely due to a lack of efficient approaches for inducing site-specific G4s/R-loops into the genome. Several studies reported dedicated helicases capable of unwinding G4s/R-loops, yet whether additional factors exist and how different types of TRCs are resolved remains unknown. In this project, I aim to dissect the fundamental mechanisms that protect cells from TRCs at DNA loci harbouring G4s/R-loops. To do so, I will establish a novel system with site-specific G4/R-loop substrates in living cells and I will systematically investigate their protein composition to identify novel factors in G4/R-loop metabolism. I will further examine the genetic vulnerabilities of candidate G4/R-loop helicase-deficient cells and the regulatory mechanisms underlying G4/R-loop unwinding by these helicases. As mutations in several G4/R-loop helicases predispose to various cancers and genetic disorders, a detailed understanding of the basic mechanisms controlling G4/R-loop removal is of utmost importance, and will shed light on disease aetiology and the rational development of more targeted therapeutic strategies.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN.
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Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
NW1 1AT London
Royaume-Uni