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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Functional analysis of ribosome heterogeneity during zebrafish embryogenesis

Description du projet

L’hétérogénéité des ribosomes pendant l’embryogenèse du poisson zèbre

L’embryogenèse implique des changements coordonnés de l’expression génétique au niveau translationnel et transcriptionnel. Chez le poisson zèbre, la traduction aux premiers stades du développement embryonnaire repose sur des ribosomes maternels, dérivés des ovocytes, qui sont entièrement remplacés par des ribosomes somatiques fraîchement synthétisés dans les cinq jours qui suivent la fertilisation. Le projet RiboHeterogeneity, financé par l’UE, étudiera le potentiel régulateur des ribosomes somatiques et maternels lors de l’embryogenèse du poisson zèbre. Les recherches analyseront les activités translationnelles des ribosomes somatiques et maternels, la spécificité des substrats, la longueur et la séquence d’ARNm, la cinétique de la traduction et la régulation de la dégradation des ribosomes pendant l’embryogenèse. Les résultats du projet sont à même de révéler de nouveaux mécanismes régulateurs de l’embryogenèse chez les vertébrés et feront la lumière sur l’importance fonctionnelle des ribosomes hétérogènes.

Objectif

The process of embryogenesis involves coordinated changes in gene expression at both transcriptional and translational levels. In zebrafish, translation at early stages of embryo development relies on maternal, oocyte-derived ribosomes which are completely replaced by newly synthesized somatic ribosomes within 5 days after fertilization. Strikingly, preliminary data obtained in the Pauli lab suggest that maternal and somatic ribosomes diverge not only in rRNA content but also in protein composition and structure. Despite their heterogeneity, potential differences in the function of maternal and somatic ribosomes remain unknown. The dual ribosomal system present in zebrafish embryos thus provides a unique, powerful tool to address the controversial idea regarding the existence of ‘specialized ribosomes’ having distinct functions in translation.

In the proposed research project, I will investigate the regulatory potential of maternal and somatic ribosomes during zebrafish embryogenesis. To this end, I will analyze the translational activities of maternal and somatic ribosomes by determining substrate specificity, preferred mRNA features (sequence and length) and kinetics of translation. In addition, I will study the regulation of ribosomal degradation during embryogenesis in order to understand how and why the maternal ribosomal machinery is turned-over despite the high energy cost associated with making a new set of ribosomes. To accomplish these aims, I will combine diverse state-of-the-art methodologies, including in vivo and in vitro translation assays, biochemical ribosome purification techniques, SLAM-seq, and molecular and genetic studies in zebrafish. The results obtained have the potential to reveal novel regulatory mechanisms acting during vertebrate embryogenesis and will help to pinpoint the functional significance of heterogeneous ribosomes.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 174 167,04
Adresse
CAMPUS-VIENNA-BIOCENTER 1
1030 Wien
Autriche

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Région
Ostösterreich Wien Wien
Type d’activité
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 174 167,04
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