Description du projet
L’hétérogénéité des ribosomes pendant l’embryogenèse du poisson zèbre
L’embryogenèse implique des changements coordonnés de l’expression génétique au niveau translationnel et transcriptionnel. Chez le poisson zèbre, la traduction aux premiers stades du développement embryonnaire repose sur des ribosomes maternels, dérivés des ovocytes, qui sont entièrement remplacés par des ribosomes somatiques fraîchement synthétisés dans les cinq jours qui suivent la fertilisation. Le projet RiboHeterogeneity, financé par l’UE, étudiera le potentiel régulateur des ribosomes somatiques et maternels lors de l’embryogenèse du poisson zèbre. Les recherches analyseront les activités translationnelles des ribosomes somatiques et maternels, la spécificité des substrats, la longueur et la séquence d’ARNm, la cinétique de la traduction et la régulation de la dégradation des ribosomes pendant l’embryogenèse. Les résultats du projet sont à même de révéler de nouveaux mécanismes régulateurs de l’embryogenèse chez les vertébrés et feront la lumière sur l’importance fonctionnelle des ribosomes hétérogènes.
Objectif
The process of embryogenesis involves coordinated changes in gene expression at both transcriptional and translational levels. In zebrafish, translation at early stages of embryo development relies on maternal, oocyte-derived ribosomes which are completely replaced by newly synthesized somatic ribosomes within 5 days after fertilization. Strikingly, preliminary data obtained in the Pauli lab suggest that maternal and somatic ribosomes diverge not only in rRNA content but also in protein composition and structure. Despite their heterogeneity, potential differences in the function of maternal and somatic ribosomes remain unknown. The dual ribosomal system present in zebrafish embryos thus provides a unique, powerful tool to address the controversial idea regarding the existence of ‘specialized ribosomes’ having distinct functions in translation.
In the proposed research project, I will investigate the regulatory potential of maternal and somatic ribosomes during zebrafish embryogenesis. To this end, I will analyze the translational activities of maternal and somatic ribosomes by determining substrate specificity, preferred mRNA features (sequence and length) and kinetics of translation. In addition, I will study the regulation of ribosomal degradation during embryogenesis in order to understand how and why the maternal ribosomal machinery is turned-over despite the high energy cost associated with making a new set of ribosomes. To accomplish these aims, I will combine diverse state-of-the-art methodologies, including in vivo and in vitro translation assays, biochemical ribosome purification techniques, SLAM-seq, and molecular and genetic studies in zebrafish. The results obtained have the potential to reveal novel regulatory mechanisms acting during vertebrate embryogenesis and will help to pinpoint the functional significance of heterogeneous ribosomes.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
1030 Wien
Autriche