Skip to main content
Weiter zur Homepage der Europäischen Kommission (öffnet in neuem Fenster)
Deutsch de
CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
CORDIS

Functional analysis of ribosome heterogeneity during zebrafish embryogenesis

Projektbeschreibung

Heterogenität der Ribosomen während der Embryogenese bei Zebrafischen

Für die Embryogenese sind koordinierte Veränderungen der Genexpression auf transkriptioneller und translationaler Ebene notwendig. Bei Zebrafischen ist die Translation in den frühen Phasen der embryonalen Entwicklung auf von der Eizelle der Mutter abgeleitete Ribosomen angewiesen, die innerhalb von fünf Tagen nach der Befruchtung vollständig durch neugebildete somatische Ribosomen ersetzt werden. Das EU-finanzierte Projekt RiboHeterogeneity wird das regulierende Potenzial der mütterlichen und somatischen Ribosomen während der Embryogenese bei Zebrafischen untersuchen. Die Forschung wird die translationalen Aktivitäten der mütterlichen und somatischen Ribosomen, die Substratspezifität, die Sequenz und Länge der mRNA, die Kinetik der Translation sowie die Regulierung des Ribosomenabbaus während der Embryogenese analysieren. Die Ergebnisse des Projekts bergen das Potenzial, neue Regulationsmechanismen der Embryogenese bei Wirbeltieren offenzulegen und ein neues Licht auf die funktionale Bedeutung der heterogenen Ribosomen zu werfen.

Ziel

The process of embryogenesis involves coordinated changes in gene expression at both transcriptional and translational levels. In zebrafish, translation at early stages of embryo development relies on maternal, oocyte-derived ribosomes which are completely replaced by newly synthesized somatic ribosomes within 5 days after fertilization. Strikingly, preliminary data obtained in the Pauli lab suggest that maternal and somatic ribosomes diverge not only in rRNA content but also in protein composition and structure. Despite their heterogeneity, potential differences in the function of maternal and somatic ribosomes remain unknown. The dual ribosomal system present in zebrafish embryos thus provides a unique, powerful tool to address the controversial idea regarding the existence of ‘specialized ribosomes’ having distinct functions in translation.

In the proposed research project, I will investigate the regulatory potential of maternal and somatic ribosomes during zebrafish embryogenesis. To this end, I will analyze the translational activities of maternal and somatic ribosomes by determining substrate specificity, preferred mRNA features (sequence and length) and kinetics of translation. In addition, I will study the regulation of ribosomal degradation during embryogenesis in order to understand how and why the maternal ribosomal machinery is turned-over despite the high energy cost associated with making a new set of ribosomes. To accomplish these aims, I will combine diverse state-of-the-art methodologies, including in vivo and in vitro translation assays, biochemical ribosome purification techniques, SLAM-seq, and molecular and genetic studies in zebrafish. The results obtained have the potential to reveal novel regulatory mechanisms acting during vertebrate embryogenesis and will help to pinpoint the functional significance of heterogeneous ribosomes.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2019

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Netto-EU-Beitrag
€ 174 167,04
Adresse
CAMPUS-VIENNA-BIOCENTER 1
1030 Wien
Österreich
Region
Ostösterreich Wien Wien
Aktivitätstyp
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Links
Gesamtkosten
€ 174 167,04