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Information encoding to polymers

Projektbeschreibung

Aminosäure-Sequenzen könnten Einsen und Nullen ersetzen

Informationen werden sowohl in der Natur als auch synthetisch auf vielfältige Weise codiert. Buchstabenfolgen bilden Wörter, Folgen mit Nullen und Einsen enthalten digitale Daten und Aminosäure-Sequenzen werden zur Herstellung langkettiger Proteine verwendet. Die Natur inspiriert oft die Wissenschaft, was hier erneut der Fall ist, wenn es um die enorme und wachsende Datenmenge geht, die im Zeitalter von Datenbanken und Internet gespeichert und ausgewertet werden muss. Polymere aus Aminosäurebausteinen bieten eine interessante Möglichkeit zur Speicherung von Informationen. Die Nutzung dieser Bausteine beruht jedoch auf einer exzellenten Kontrolle über die Synthese von langen Polymeren mit Sequenzordnung, was sich in vitro als ziemlich schwierig erwiesen hat. Das EU-finanzierte Projekt POLINFO untersucht das Potenzial der Einführung einer spontanen Sequenzordnung unter Nichtgleichgewichtsbedingungen mithilfe eines Berechnungsmodells über theoretischer Prozesse. Die Ergebnisse dieses Modells könnten experimentelle Studien erleichtern.

Ziel

Data acquisition and mining is currently the principal driving force of technological advances. Massive expansion of the field requires implementation of new solutions in data storing and retrieving, where targeted solutions need not only be resource-sustainable and recyclable, but also have to posses high information-encoding density to decrease space allocated for storage. Polymers represent natural candidates for the task, as nucleic acids already efficiently encode for vast biological complexity. However, the synthesis of long sequence-ordered polymers in vitro has proven to be challenging and remains an open question. Our project aims to address whether conditions of spontaneous sequence ordering can be achieved under non-equilibrium conditions. To that extent, we build a computational model that bridges a coarse-grained representation of polymer with stochastic kinetics modelling of polymerization and depolymerization reaction. The model is a novel approach to exploring information encoding to polymers, as it is not limited by master equation solution feasibility, and allows, for the first time, to interpret the informational content of the generated sequence through its effect on polymer structure. We explore novel theoretical ideas on non-equilibrium systems that have recently emerged, suggesting that spontaneous ordering of systems takes the path of maximum heat dissipation, which we plan to test for the first time in the context of information generation. In addition, we aim to understand the timescales pertinent to sequence ordering under non-equilibrium conditions, where specifically the concentration number of monomer types is varied in time. Finally, we wish to understand the conditions which allow for creation of autocatalytic self-replicative sequence sets, with emphasis on timescales relevant to this process. Overall, we aim to identify timescales pertinent to generation of ordered sequences, which could pave way to new experimental strategies.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2019

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 184 707,84
Adresse
RUE MICHEL ANGE 3
75794 PARIS
Frankreich

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Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 184 707,84
Mein Booklet 0 0