Descrizione del progetto
Le sequenze di amminoacidi potrebbero sostituire quelle di uno e zero
Le informazioni sono codificate in molti modi sia in natura che a livello sintetico. Le sequenze di lettere formano parole, le sequenze di zero e uno comprendono dati digitali e le sequenze di amminoacidi vengono utilizzate per produrre proteine a catena lunga. La natura ispira spesso la scienza, e questo è ancora una volta il caso dell’enorme e crescente quantità di dati che devono essere archiviati ed estratti nell’era delle banche dati e di Internet. I polimeri costituiti da mattoni di amminoacidi offrono un modo affascinante per archiviare informazioni, ma il loro sfruttamento si basa su un perfetto controllo della sintesi di polimeri ordinati per lunghe sequenze, che si è rivelato piuttosto impegnativo in vitro. Il progetto POLINFO, finanziato dall’UE, sta studiando il potenziale di indurre l’ordinamento di sequenze spontanee in condizioni di non equilibrio attraverso un modello computazionale di processi teorici, con risultati che potrebbero aprire la strada a studi sperimentali.
Obiettivo
Data acquisition and mining is currently the principal driving force of technological advances. Massive expansion of the field requires implementation of new solutions in data storing and retrieving, where targeted solutions need not only be resource-sustainable and recyclable, but also have to posses high information-encoding density to decrease space allocated for storage. Polymers represent natural candidates for the task, as nucleic acids already efficiently encode for vast biological complexity. However, the synthesis of long sequence-ordered polymers in vitro has proven to be challenging and remains an open question. Our project aims to address whether conditions of spontaneous sequence ordering can be achieved under non-equilibrium conditions. To that extent, we build a computational model that bridges a coarse-grained representation of polymer with stochastic kinetics modelling of polymerization and depolymerization reaction. The model is a novel approach to exploring information encoding to polymers, as it is not limited by master equation solution feasibility, and allows, for the first time, to interpret the informational content of the generated sequence through its effect on polymer structure. We explore novel theoretical ideas on non-equilibrium systems that have recently emerged, suggesting that spontaneous ordering of systems takes the path of maximum heat dissipation, which we plan to test for the first time in the context of information generation. In addition, we aim to understand the timescales pertinent to sequence ordering under non-equilibrium conditions, where specifically the concentration number of monomer types is varied in time. Finally, we wish to understand the conditions which allow for creation of autocatalytic self-replicative sequence sets, with emphasis on timescales relevant to this process. Overall, we aim to identify timescales pertinent to generation of ordered sequences, which could pave way to new experimental strategies.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole acidi nucleici
- scienze naturali scienze chimiche scienze dei polimeri
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
75794 PARIS
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.