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Deciphering fundamental constraints on pathogen adaptation

Description du projet

Compromis de survie en cas d’infection par un agent pathogène

L’adaptation à de nouvelles conditions est un déterminant majeur de l’évolution, mais l’amélioration d’un caractère se fait souvent aux dépens d’un autre. Comprendre comment ce compromis a lieu dans les agents pathogènes peut permettre d’améliorer notre capacité à prédire l’émergence d’une maladie. En utilisant l’agent pathogène du blé Zymoseptoria tritici comme organisme modèle, le projet TRADEOFF, financé par l’UE, étudiera les contraintes environnementales et génétiques conduisant à des compromis sur le cycle de vie. Les scientifiques effectueront une analyse de l’expression des gènes sur des isolats mondiaux de pathogènes et détermineront comment les compromis évoluent en réponse aux conditions environnementales. Ils évalueront également l’importance des contraintes génétiques dans la définition des compromis. En plus d’apporter de nouvelles informations sur l’écologie, le projet posera les bases de l’exploitation des compromis pour gérer les maladies et améliorer la sécurité alimentaire.

Objectif

Adaptation is considered to be a fundamental determinant of organismal evolution, but getting better at something may have an evolutionary cost. This limitation is encapsulated in the concept of a trade-off, where improvements in one trait come at the expense of another. For example, pathogens that excel at surviving in their host’s absence are often worse at causing disease, and vice versa. Knowledge of how trade-offs impact pathogens is particularly important as it would enhance our ability to predict disease emergence. However, while observations of trade-offs abound, we know little about why they occur. In order to gain crucial insight into pathogen evolution, I propose to investigate the underlying selective, environmental, and genetic constraints leading to life history trade-offs in Zymoseptoria tritici, an economically important pathogen of wheat in Europe with defined infection and survival stages. We will first determine the selective constraints on adaptation by contrasting the signatures of selection on genes expressed during survival, during infection, or both, across 15 global isolates. Then, by phenotyping a diverse panel of 150 Swiss isolates, we will identify infection-survival trade-offs, and test whether or not the strength and direction of trade-offs change in response to environmental conditions anticipated under future climate change. Finally, we will evaluate the importance of genetic constraints for shaping trade-offs by identifying loci contributing to both infection and survival (i.e. pleiotropy), and will furthermore determine whether or not the mechanisms of pleiotropy are related to carbon metabolism. Identifying the causes of trade-offs in a plant pathogen will not only produce broadly relevant insights into organismal biology and ecology, but will help European scientists exploit trade-offs to sustainably manage disease and bolster food security.

Mots‑clés

Coordinateur

UNIVERSITE DE NEUCHATEL
Contribution nette de l'UE
€ 191 149,44
Adresse
FAUBOURG DE L'HOPITAL 41
2000 NEUCHATEL
Suisse

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Région
Schweiz/Suisse/Svizzera Espace Mittelland Neuchâtel
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 191 149,44