Genetically encoded sensors for imaging neurochemical dynamics in vivo

Información del proyecto

OPTONEUROCHEM

Identificador del acuerdo de subvención: 891959

DOI

10.3030/891959

Fecha de la firma de la CE 1 Octubre 2020

Fecha de inicio 1 Febrero 2021

Fecha de finalización 31 Julio 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 498 750,00

Aportación de la UE

€ 1 498 750,00

Coordinado por

UNIVERSITAT ZURICH
Switzerland

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Publicaciones

Non-peer reviewed articles (5)

Multimodal intrinsic activation of GPCRs in ultrastable plasma membrane nanodomains

Autores: Gabriele Kockelkoren, Jens Carstensen, Line Lauritsen, Eleftheria Kazepidou, Asger Tonnesen, Christopher G. Shuttle, Paulina S. Kaas, Ankur Gupta, Artù Breuer, Søren G. F. Rasmussen, Loïc Duffet, Tony Warne, Tommaso Patriarchi, Christopher G. Tate, Mark Uline, Dimitrios Stamou
Publicado en: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editor: BioRxiv
DOI: 10.1101/2024.02.28.582451

Locus Coeruleus firing patterns selectively modulate brain activity and dynamics

Autores: Christina Grimm, Sian N. Duss, Mattia Privitera, Brandon R. Munn, Stefan Frässle, Maria Chernysheva, Tommaso Patriarchi, Daniel Razansky, Nicole Wenderoth, James M. Shine, Johannes Bohacek, Valerio Zerbi
Publicado en: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Editor: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.29.505672

Prime editing of the β1 adrenoceptor in the brain reprograms mouse behavior

Autores: Desirée Böck, Lisa Tidecks, Maria Wilhelm, Yanik Weber, Eleonora Ioannidi, Jonas Mumenthaler, Tanja Rothgangl, Lukas Schmidheini, Sharan Janjuha, Tommaso Patriarchi, Gerald Schwank
Publicado en: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Editor: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.05.19.541410

Base editing of Ptbp1 in neurons alleviates symptoms in a mouse model for Parkinson’s disease

Autores: Desirée Böck, Maria Wilhelm, Jonas Mumenthaler, Daniel Fabio Carpanese, Simon d‘Aquin, Alessio Cremonesi, Anahita Rassi, Johannes Häberle, Tommaso Patriarchi, Gerald Schwank
Publicado en: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editor: BioRxiv
DOI: 10.1101/2024.03.22.586274

State of the art imaging of neurotransmission in animal models

Autores: Tommaso Patriarchi, Anna Beyeler
Publicado en: Journal of Neuroscience Methods, 2022, ISSN 0165-0270
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2022.109623

Peer reviewed articles (15)

Distinct sub-second dopamine signaling in dorsolateral striatum measured by a genetically-encoded fluorescent sensor

Autores: Armando G. Salinas, Jeong Oen Lee, Shana M. Augustin, Shiliang Zhang, Tommaso Patriarchi, Lin Tian, Marisela Morales, Yolanda Mateo, David M. Lovinger
Publicado en: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41581-3

Development of a genetically-encoded sensor for probing endogenous nociceptin opioid peptide release

Autores: Xuehan Zhou, Carrie Stine, Patricia Oliveira Prada, Debora Fusca, Kevin Assoumou, Jan Dernic, Musadiq A. Bhat, Ananya S. Achanta, Joseph C. Johnson, Sanjana Jadhav, Corinna A. Bauder, Lukas Steuernagel, Luca Ravotto, Dietmar Benke, Bruno Weber, Miriam Stoeber, Peter Kloppenburg, Jens C. Brüning, Michael R. Bruchas, Tommaso Patriarchi
Publicado en: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49712-0

A photocaged orexin-B for spatiotemporally precise control of orexin signaling

Autores: Duffet, Loic; Tatarskiy, Petr V; Harada, Masaya; Williams, Elyse T; Hartrampf, Nina; Patriarchi, Tommaso
Publicado en: Cell Chemical Biology, 29 (12), Edición 2, 2022, ISSN 2451-9448
Editor: Elsevier
DOI: 10.3929/ethz-b-000589631

Optical tools for visualizing and controlling human GLP-1 receptor activation with high spatiotemporal resolution

Autores: Loïc Duffet, Elyse T Williams, Andrea Gresch, Simin Chen, Musadiq A Bhat, Dietmar Benke, Nina Hartrampf, Tommaso Patriarchi
Publicado en: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.86628

A genetically encoded sensor for in vivo imaging of orexin neuropeptides

Autores: Loïc Duffet, Seher Kosar, Mariangela Panniello, Bianca Viberti, Edward Bracey, Anna D. Zych, Arthur Radoux-Mergault, Xuehan Zhou, Jan Dernic, Luca Ravotto, Yuan-Chen Tsai, Marta Figueiredo, Shiva K. Tyagarajan, Bruno Weber, Miriam Stoeber, Nadine Gogolla, Markus H. Schmidt, Antoine R. Adamantidis, Tommaso Fellin, Denis Burdakov, Tommaso Patriarchi
Publicado en: Nature Methods, Edición 19, 2022, Página(s) 231-241, ISSN 1548-7091
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-021-01390-2

Lights, fiber, action! A primer on in vivo fiber photometry

Autores: Simpson, EH; Akam, T; Patriarchi, T; Blanco-Pozo, M; Burgeno, LM; Mohebi, A; Cragg, SJ; Walton, ME
Publicado en: Neuron, 112 (5), Edición 3, 2023, ISSN 1097-4199
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.neuron.2023.11.016

A photoswitchable GPCR-based opsin for presynaptic inhibition

Autores: Bryan A. Copits, Raaj Gowrishankar, Patrick R. O’Neill, Jun-Nan Li, Kasey S. Girven, Judy J. Yoo, Xenia Meshik, Kyle E. Parker, Skylar M. Spangler, Abigail J. Elerding, Bobbie J. Brown, Sofia E. Shirley, Kelly K.L. Ma, Alexis M. Vasquez, M. Christine Stander, Vani Kalyanaraman, Sherri K. Vogt, Vijay K. Samineni, Tommaso Patriarchi, Lin Tian, N. Gautam, Roger K. Sunahara, Robert W. Gereau IV, Mic
Publicado en: Neuron, 2021, ISSN 1097-4199
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.neuron.2021.04.026

Probing PAC1 receptor activation across species with an engineered sensor

Autores: Reto B. Cola, Salome N. Niethammer, Preethi Rajamannar, Andrea Gresch, Musadiq A. Bhat, Kevin Assoumou, Elyse T. Williams, Patrick Hauck, Nina Hartrampf, Dietmar Benke, Miriam Stoeber, Gil Levkowitz, Sarah Melzer, Tommaso Patriarchi
Publicado en: eLife, 2024, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.96496.1

A chemogenetic approach for dopamine imaging with tunable sensitivity.

Autores: Marie A. Labouesse, Maria Wilhelm, Zacharoula Kagiampaki, Andrew G. Yee, Raphaelle Denis, Masaya Harada, Andrea Gresch, Alina-Măriuca Marinescu, Kanako Otomo, Sebastiano Curreli, Laia Serratosa Capdevila, Xuehan Zhou, Reto B. Cola, Luca Ravotto, Chaim Glück, Stanislav Cherepanov, Bruno Weber, Xin Zhou, Jason Katner, Kjell A. Svensson, Tommaso Fellin, Louis-Eric Trudeau, Christopher P. Ford, Yaro
Publicado en: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49442-3

Stimulation of VTA dopamine inputs to LH upregulates orexin neuronal activity in a DRD2-dependent manner

Autores: Harada, Masaya; Capdevila, Laia Serratosa; Wilhelm, Maria; Burdakov, Denis; Patriarchi, Tommaso
Publicado en: eLife, 12, Edición 2, 2023, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.90158.3

Multimodal detection of dopamine by sniffer cells expressing genetically encoded fluorescent sensors

Autores: Klein Herenbrink, Carmen; Støier, Jonatan Fullerton; Reith, William Dalseg; Dagra, Abeer; Gregorek, Miguel Alejandro Cuadrado; Cola, Reto B; Patriarchi, Tommaso; Li, Yulong; Tian, Lin; Gether, Ulrik; Herborg, Freja
Publicado en: Communications Biology, Edición 1, 2022, ISSN 2399-3642
Editor: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-022-03488-5

Engineering, applications, and future perspectives of <scp>GPCR</scp>‐based genetically encoded fluorescent indicators for neuromodulators

Autores: Valentin Lu Rohner; Paul J. Lamothe‐Molina; Tommaso Patriarchi
Publicado en: Journal of Neurochemistry, Edición 1, 2024, ISSN 0022-3042
Editor: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jnc.16045

Orexin neurons track temporal features of blood glucose in behaving mice

Autores: Paulius Viskaitis, Alexander L. Tesmer, Ziyu Liu, Mahesh M. Karnani, Myrtha Arnold, Dane Donegan, Eva Bracey, Nikola Grujic, Tommaso Patriarchi, Daria Peleg-Raibstein, Denis Burdakov
Publicado en: Nature Neuroscience, 2024, ISSN 1097-6256
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-024-01648-w

A versatile GPCR toolkit to track in vivo neuromodulation: not a one-size-fits-all sensor

Autores: Marie A. Labouesse, Tommaso Patriarchi
Publicado en: Neuropsychopharmacology, 2021, ISSN 0893-133X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41386-021-00982-y

Sensitive multicolor indicators for monitoring norepinephrine in vivo.

Autores: Zacharoula Kagiampaki, Valentin Rohner, Cedric Kiss, Sebastiano Curreli, Alexander Dieter, Maria Wilhelm, Masaya Harada, Sian N. Duss, Jan Dernic, Musadiq A. Bhat, Xuehan Zhou, Luca Ravotto, Tim Ziebarth, Laura Moreno Wasielewski, Latife Sönmez, Dietmar Benke, Bruno Weber, Johannes Bohacek, Andreas Reiner, J. Simon Wiegert, Tommaso Fellin & Tommaso Patriarchi
Publicado en: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01959-z