Genetically encoded sensors for imaging neurochemical dynamics in vivo

Informations projet

OPTONEUROCHEM

N° de convention de subvention: 891959

DOI

10.3030/891959

Date de signature de la CE 1 Octobre 2020

Date de début 1 Février 2021

Date de fin 31 Juillet 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 498 750,00

Contribution de l’UE

€ 1 498 750,00

Coordonné par

UNIVERSITAT ZURICH
Switzerland

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Publications

Non-peer reviewed articles (5)

Multimodal intrinsic activation of GPCRs in ultrastable plasma membrane nanodomains

Auteurs: Gabriele Kockelkoren, Jens Carstensen, Line Lauritsen, Eleftheria Kazepidou, Asger Tonnesen, Christopher G. Shuttle, Paulina S. Kaas, Ankur Gupta, Artù Breuer, Søren G. F. Rasmussen, Loïc Duffet, Tony Warne, Tommaso Patriarchi, Christopher G. Tate, Mark Uline, Dimitrios Stamou
Publié dans: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2024.02.28.582451

Locus Coeruleus firing patterns selectively modulate brain activity and dynamics

Auteurs: Christina Grimm, Sian N. Duss, Mattia Privitera, Brandon R. Munn, Stefan Frässle, Maria Chernysheva, Tommaso Patriarchi, Daniel Razansky, Nicole Wenderoth, James M. Shine, Johannes Bohacek, Valerio Zerbi
Publié dans: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.29.505672

Prime editing of the β1 adrenoceptor in the brain reprograms mouse behavior

Auteurs: Desirée Böck, Lisa Tidecks, Maria Wilhelm, Yanik Weber, Eleonora Ioannidi, Jonas Mumenthaler, Tanja Rothgangl, Lukas Schmidheini, Sharan Janjuha, Tommaso Patriarchi, Gerald Schwank
Publié dans: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.05.19.541410

Base editing of Ptbp1 in neurons alleviates symptoms in a mouse model for Parkinson’s disease

Auteurs: Desirée Böck, Maria Wilhelm, Jonas Mumenthaler, Daniel Fabio Carpanese, Simon d‘Aquin, Alessio Cremonesi, Anahita Rassi, Johannes Häberle, Tommaso Patriarchi, Gerald Schwank
Publié dans: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2024.03.22.586274

State of the art imaging of neurotransmission in animal models

Auteurs: Tommaso Patriarchi, Anna Beyeler
Publié dans: Journal of Neuroscience Methods, 2022, ISSN 0165-0270
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2022.109623

Peer reviewed articles (15)

Distinct sub-second dopamine signaling in dorsolateral striatum measured by a genetically-encoded fluorescent sensor

Auteurs: Armando G. Salinas, Jeong Oen Lee, Shana M. Augustin, Shiliang Zhang, Tommaso Patriarchi, Lin Tian, Marisela Morales, Yolanda Mateo, David M. Lovinger
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41581-3

Development of a genetically-encoded sensor for probing endogenous nociceptin opioid peptide release

Auteurs: Xuehan Zhou, Carrie Stine, Patricia Oliveira Prada, Debora Fusca, Kevin Assoumou, Jan Dernic, Musadiq A. Bhat, Ananya S. Achanta, Joseph C. Johnson, Sanjana Jadhav, Corinna A. Bauder, Lukas Steuernagel, Luca Ravotto, Dietmar Benke, Bruno Weber, Miriam Stoeber, Peter Kloppenburg, Jens C. Brüning, Michael R. Bruchas, Tommaso Patriarchi
Publié dans: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49712-0

A photocaged orexin-B for spatiotemporally precise control of orexin signaling

Auteurs: Duffet, Loic; Tatarskiy, Petr V; Harada, Masaya; Williams, Elyse T; Hartrampf, Nina; Patriarchi, Tommaso
Publié dans: Cell Chemical Biology, 29 (12), Numéro 2, 2022, ISSN 2451-9448
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.3929/ethz-b-000589631

Optical tools for visualizing and controlling human GLP-1 receptor activation with high spatiotemporal resolution

Auteurs: Loïc Duffet, Elyse T Williams, Andrea Gresch, Simin Chen, Musadiq A Bhat, Dietmar Benke, Nina Hartrampf, Tommaso Patriarchi
Publié dans: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.86628

A genetically encoded sensor for in vivo imaging of orexin neuropeptides

Auteurs: Loïc Duffet, Seher Kosar, Mariangela Panniello, Bianca Viberti, Edward Bracey, Anna D. Zych, Arthur Radoux-Mergault, Xuehan Zhou, Jan Dernic, Luca Ravotto, Yuan-Chen Tsai, Marta Figueiredo, Shiva K. Tyagarajan, Bruno Weber, Miriam Stoeber, Nadine Gogolla, Markus H. Schmidt, Antoine R. Adamantidis, Tommaso Fellin, Denis Burdakov, Tommaso Patriarchi
Publié dans: Nature Methods, Numéro 19, 2022, Page(s) 231-241, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-021-01390-2

Lights, fiber, action! A primer on in vivo fiber photometry

Auteurs: Simpson, EH; Akam, T; Patriarchi, T; Blanco-Pozo, M; Burgeno, LM; Mohebi, A; Cragg, SJ; Walton, ME
Publié dans: Neuron, 112 (5), Numéro 3, 2023, ISSN 1097-4199
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.neuron.2023.11.016

A photoswitchable GPCR-based opsin for presynaptic inhibition

Auteurs: Bryan A. Copits, Raaj Gowrishankar, Patrick R. O’Neill, Jun-Nan Li, Kasey S. Girven, Judy J. Yoo, Xenia Meshik, Kyle E. Parker, Skylar M. Spangler, Abigail J. Elerding, Bobbie J. Brown, Sofia E. Shirley, Kelly K.L. Ma, Alexis M. Vasquez, M. Christine Stander, Vani Kalyanaraman, Sherri K. Vogt, Vijay K. Samineni, Tommaso Patriarchi, Lin Tian, N. Gautam, Roger K. Sunahara, Robert W. Gereau IV, Mic
Publié dans: Neuron, 2021, ISSN 1097-4199
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.neuron.2021.04.026

Probing PAC1 receptor activation across species with an engineered sensor

Auteurs: Reto B. Cola, Salome N. Niethammer, Preethi Rajamannar, Andrea Gresch, Musadiq A. Bhat, Kevin Assoumou, Elyse T. Williams, Patrick Hauck, Nina Hartrampf, Dietmar Benke, Miriam Stoeber, Gil Levkowitz, Sarah Melzer, Tommaso Patriarchi
Publié dans: eLife, 2024, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.96496.1

A chemogenetic approach for dopamine imaging with tunable sensitivity.

Auteurs: Marie A. Labouesse, Maria Wilhelm, Zacharoula Kagiampaki, Andrew G. Yee, Raphaelle Denis, Masaya Harada, Andrea Gresch, Alina-Măriuca Marinescu, Kanako Otomo, Sebastiano Curreli, Laia Serratosa Capdevila, Xuehan Zhou, Reto B. Cola, Luca Ravotto, Chaim Glück, Stanislav Cherepanov, Bruno Weber, Xin Zhou, Jason Katner, Kjell A. Svensson, Tommaso Fellin, Louis-Eric Trudeau, Christopher P. Ford, Yaro
Publié dans: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49442-3

Stimulation of VTA dopamine inputs to LH upregulates orexin neuronal activity in a DRD2-dependent manner

Auteurs: Harada, Masaya; Capdevila, Laia Serratosa; Wilhelm, Maria; Burdakov, Denis; Patriarchi, Tommaso
Publié dans: eLife, 12, Numéro 2, 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.90158.3

Multimodal detection of dopamine by sniffer cells expressing genetically encoded fluorescent sensors

Auteurs: Klein Herenbrink, Carmen; Støier, Jonatan Fullerton; Reith, William Dalseg; Dagra, Abeer; Gregorek, Miguel Alejandro Cuadrado; Cola, Reto B; Patriarchi, Tommaso; Li, Yulong; Tian, Lin; Gether, Ulrik; Herborg, Freja
Publié dans: Communications Biology, Numéro 1, 2022, ISSN 2399-3642
Éditeur: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-022-03488-5

Engineering, applications, and future perspectives of <scp>GPCR</scp>‐based genetically encoded fluorescent indicators for neuromodulators

Auteurs: Valentin Lu Rohner; Paul J. Lamothe‐Molina; Tommaso Patriarchi
Publié dans: Journal of Neurochemistry, Numéro 1, 2024, ISSN 0022-3042
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jnc.16045

Orexin neurons track temporal features of blood glucose in behaving mice

Auteurs: Paulius Viskaitis, Alexander L. Tesmer, Ziyu Liu, Mahesh M. Karnani, Myrtha Arnold, Dane Donegan, Eva Bracey, Nikola Grujic, Tommaso Patriarchi, Daria Peleg-Raibstein, Denis Burdakov
Publié dans: Nature Neuroscience, 2024, ISSN 1097-6256
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-024-01648-w

A versatile GPCR toolkit to track in vivo neuromodulation: not a one-size-fits-all sensor

Auteurs: Marie A. Labouesse, Tommaso Patriarchi
Publié dans: Neuropsychopharmacology, 2021, ISSN 0893-133X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41386-021-00982-y

Sensitive multicolor indicators for monitoring norepinephrine in vivo.

Auteurs: Zacharoula Kagiampaki, Valentin Rohner, Cedric Kiss, Sebastiano Curreli, Alexander Dieter, Maria Wilhelm, Masaya Harada, Sian N. Duss, Jan Dernic, Musadiq A. Bhat, Xuehan Zhou, Luca Ravotto, Tim Ziebarth, Laura Moreno Wasielewski, Latife Sönmez, Dietmar Benke, Bruno Weber, Johannes Bohacek, Andreas Reiner, J. Simon Wiegert, Tommaso Fellin & Tommaso Patriarchi
Publié dans: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01959-z