Genetically encoded sensors for imaging neurochemical dynamics in vivo

Informazioni relative al progetto

OPTONEUROCHEM

ID dell’accordo di sovvenzione: 891959

DOI

10.3030/891959

Data della firma CE 1 Ottobre 2020

Data di avvio 1 Febbraio 2021

Data di completamento 31 Luglio 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 498 750,00

Contributo UE

€ 1 498 750,00

Coordinato da

UNIVERSITAT ZURICH
Switzerland

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Pubblicazioni

Non-peer reviewed articles (5)

Multimodal intrinsic activation of GPCRs in ultrastable plasma membrane nanodomains

Autori: Gabriele Kockelkoren, Jens Carstensen, Line Lauritsen, Eleftheria Kazepidou, Asger Tonnesen, Christopher G. Shuttle, Paulina S. Kaas, Ankur Gupta, Artù Breuer, Søren G. F. Rasmussen, Loïc Duffet, Tony Warne, Tommaso Patriarchi, Christopher G. Tate, Mark Uline, Dimitrios Stamou
Pubblicato in: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2024.02.28.582451

Locus Coeruleus firing patterns selectively modulate brain activity and dynamics

Autori: Christina Grimm, Sian N. Duss, Mattia Privitera, Brandon R. Munn, Stefan Frässle, Maria Chernysheva, Tommaso Patriarchi, Daniel Razansky, Nicole Wenderoth, James M. Shine, Johannes Bohacek, Valerio Zerbi
Pubblicato in: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.29.505672

Prime editing of the β1 adrenoceptor in the brain reprograms mouse behavior

Autori: Desirée Böck, Lisa Tidecks, Maria Wilhelm, Yanik Weber, Eleonora Ioannidi, Jonas Mumenthaler, Tanja Rothgangl, Lukas Schmidheini, Sharan Janjuha, Tommaso Patriarchi, Gerald Schwank
Pubblicato in: BioRxiv, 2022, ISSN 2692-8205
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.05.19.541410

Base editing of Ptbp1 in neurons alleviates symptoms in a mouse model for Parkinson’s disease

Autori: Desirée Böck, Maria Wilhelm, Jonas Mumenthaler, Daniel Fabio Carpanese, Simon d‘Aquin, Alessio Cremonesi, Anahita Rassi, Johannes Häberle, Tommaso Patriarchi, Gerald Schwank
Pubblicato in: BioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2024.03.22.586274

State of the art imaging of neurotransmission in animal models

Autori: Tommaso Patriarchi, Anna Beyeler
Pubblicato in: Journal of Neuroscience Methods, 2022, ISSN 0165-0270
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2022.109623

Peer reviewed articles (15)

Distinct sub-second dopamine signaling in dorsolateral striatum measured by a genetically-encoded fluorescent sensor

Autori: Armando G. Salinas, Jeong Oen Lee, Shana M. Augustin, Shiliang Zhang, Tommaso Patriarchi, Lin Tian, Marisela Morales, Yolanda Mateo, David M. Lovinger
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41581-3

Development of a genetically-encoded sensor for probing endogenous nociceptin opioid peptide release

Autori: Xuehan Zhou, Carrie Stine, Patricia Oliveira Prada, Debora Fusca, Kevin Assoumou, Jan Dernic, Musadiq A. Bhat, Ananya S. Achanta, Joseph C. Johnson, Sanjana Jadhav, Corinna A. Bauder, Lukas Steuernagel, Luca Ravotto, Dietmar Benke, Bruno Weber, Miriam Stoeber, Peter Kloppenburg, Jens C. Brüning, Michael R. Bruchas, Tommaso Patriarchi
Pubblicato in: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49712-0

A photocaged orexin-B for spatiotemporally precise control of orexin signaling

Autori: Duffet, Loic; Tatarskiy, Petr V; Harada, Masaya; Williams, Elyse T; Hartrampf, Nina; Patriarchi, Tommaso
Pubblicato in: Cell Chemical Biology, 29 (12), Numero 2, 2022, ISSN 2451-9448
Editore: Elsevier
DOI: 10.3929/ethz-b-000589631

Optical tools for visualizing and controlling human GLP-1 receptor activation with high spatiotemporal resolution

Autori: Loïc Duffet, Elyse T Williams, Andrea Gresch, Simin Chen, Musadiq A Bhat, Dietmar Benke, Nina Hartrampf, Tommaso Patriarchi
Pubblicato in: eLife, 2023, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.86628

A genetically encoded sensor for in vivo imaging of orexin neuropeptides

Autori: Loïc Duffet, Seher Kosar, Mariangela Panniello, Bianca Viberti, Edward Bracey, Anna D. Zych, Arthur Radoux-Mergault, Xuehan Zhou, Jan Dernic, Luca Ravotto, Yuan-Chen Tsai, Marta Figueiredo, Shiva K. Tyagarajan, Bruno Weber, Miriam Stoeber, Nadine Gogolla, Markus H. Schmidt, Antoine R. Adamantidis, Tommaso Fellin, Denis Burdakov, Tommaso Patriarchi
Pubblicato in: Nature Methods, Numero 19, 2022, Pagina/e 231-241, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-021-01390-2

Lights, fiber, action! A primer on in vivo fiber photometry

Autori: Simpson, EH; Akam, T; Patriarchi, T; Blanco-Pozo, M; Burgeno, LM; Mohebi, A; Cragg, SJ; Walton, ME
Pubblicato in: Neuron, 112 (5), Numero 3, 2023, ISSN 1097-4199
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.neuron.2023.11.016

A photoswitchable GPCR-based opsin for presynaptic inhibition

Autori: Bryan A. Copits, Raaj Gowrishankar, Patrick R. O’Neill, Jun-Nan Li, Kasey S. Girven, Judy J. Yoo, Xenia Meshik, Kyle E. Parker, Skylar M. Spangler, Abigail J. Elerding, Bobbie J. Brown, Sofia E. Shirley, Kelly K.L. Ma, Alexis M. Vasquez, M. Christine Stander, Vani Kalyanaraman, Sherri K. Vogt, Vijay K. Samineni, Tommaso Patriarchi, Lin Tian, N. Gautam, Roger K. Sunahara, Robert W. Gereau IV, Mic
Pubblicato in: Neuron, 2021, ISSN 1097-4199
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.neuron.2021.04.026

Probing PAC1 receptor activation across species with an engineered sensor

Autori: Reto B. Cola, Salome N. Niethammer, Preethi Rajamannar, Andrea Gresch, Musadiq A. Bhat, Kevin Assoumou, Elyse T. Williams, Patrick Hauck, Nina Hartrampf, Dietmar Benke, Miriam Stoeber, Gil Levkowitz, Sarah Melzer, Tommaso Patriarchi
Pubblicato in: eLife, 2024, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.96496.1

A chemogenetic approach for dopamine imaging with tunable sensitivity.

Autori: Marie A. Labouesse, Maria Wilhelm, Zacharoula Kagiampaki, Andrew G. Yee, Raphaelle Denis, Masaya Harada, Andrea Gresch, Alina-Măriuca Marinescu, Kanako Otomo, Sebastiano Curreli, Laia Serratosa Capdevila, Xuehan Zhou, Reto B. Cola, Luca Ravotto, Chaim Glück, Stanislav Cherepanov, Bruno Weber, Xin Zhou, Jason Katner, Kjell A. Svensson, Tommaso Fellin, Louis-Eric Trudeau, Christopher P. Ford, Yaro
Pubblicato in: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49442-3

Stimulation of VTA dopamine inputs to LH upregulates orexin neuronal activity in a DRD2-dependent manner

Autori: Harada, Masaya; Capdevila, Laia Serratosa; Wilhelm, Maria; Burdakov, Denis; Patriarchi, Tommaso
Pubblicato in: eLife, 12, Numero 2, 2023, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.90158.3

Multimodal detection of dopamine by sniffer cells expressing genetically encoded fluorescent sensors

Autori: Klein Herenbrink, Carmen; Støier, Jonatan Fullerton; Reith, William Dalseg; Dagra, Abeer; Gregorek, Miguel Alejandro Cuadrado; Cola, Reto B; Patriarchi, Tommaso; Li, Yulong; Tian, Lin; Gether, Ulrik; Herborg, Freja
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 1, 2022, ISSN 2399-3642
Editore: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s42003-022-03488-5

Engineering, applications, and future perspectives of <scp>GPCR</scp>‐based genetically encoded fluorescent indicators for neuromodulators

Autori: Valentin Lu Rohner; Paul J. Lamothe‐Molina; Tommaso Patriarchi
Pubblicato in: Journal of Neurochemistry, Numero 1, 2024, ISSN 0022-3042
Editore: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/jnc.16045

Orexin neurons track temporal features of blood glucose in behaving mice

Autori: Paulius Viskaitis, Alexander L. Tesmer, Ziyu Liu, Mahesh M. Karnani, Myrtha Arnold, Dane Donegan, Eva Bracey, Nikola Grujic, Tommaso Patriarchi, Daria Peleg-Raibstein, Denis Burdakov
Pubblicato in: Nature Neuroscience, 2024, ISSN 1097-6256
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-024-01648-w

A versatile GPCR toolkit to track in vivo neuromodulation: not a one-size-fits-all sensor

Autori: Marie A. Labouesse, Tommaso Patriarchi
Pubblicato in: Neuropsychopharmacology, 2021, ISSN 0893-133X
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41386-021-00982-y

Sensitive multicolor indicators for monitoring norepinephrine in vivo.

Autori: Zacharoula Kagiampaki, Valentin Rohner, Cedric Kiss, Sebastiano Curreli, Alexander Dieter, Maria Wilhelm, Masaya Harada, Sian N. Duss, Jan Dernic, Musadiq A. Bhat, Xuehan Zhou, Luca Ravotto, Tim Ziebarth, Laura Moreno Wasielewski, Latife Sönmez, Dietmar Benke, Bruno Weber, Johannes Bohacek, Andreas Reiner, J. Simon Wiegert, Tommaso Fellin & Tommaso Patriarchi
Pubblicato in: Nature Methods, 2023, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01959-z