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Data-driven Inference of Models from Embodied Neural Systems In Vertebrate Experiments

Projektbeschreibung

Fischhirne mithilfe optischer in-vivo-Bildgebung und fortgeschrittener mathematischer Modellierung enträtseln

Das Verhalten von Organismen – einschließlich des Menschen – zu verstehen, die Umwelteinflüsse und neurale Reize durch kognitive Verarbeitung integrieren, ist eine sehr komplexe Aufgabe. Mithilfe der Aussagekraft einfacher Modellorganismen wie dem Zebrafisch und der Leistung von rechnergestützten Analysemethoden könnte die Charakterisierung komplexer Wechselwirkungen zwischen Gehirn, Körper und Umwelt bei lebendigen Organismen ermöglicht werden. Zebrafische haben viele wesentliche Organe und Gewebe mit dem Menschen gemein, und Zebrafischlarven sind optisch transparent, sodass die in-vivo-Bildgebung der Kalziumdynamik während der Aktivierung des Nervensystems vereinfacht wird. Das EU-finanzierte Projekt DIMENSIVE erfasst die Nerventätigkeit beim Verhalten von Zebrafischen und nutzt die Daten für die Entwicklung generativer Modelle zum Verhalten im großen Maßstab. Die fortgeschrittenen statistischen Modelle werden Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern die Erstellung neuer Dateninstanzen ermöglichen, die wichtige Erkenntnisse dazu liefern, wie Verhaltensweisen aus der dynamischen Wechselwirkung von Nervensystem, Körper und Umwelt eines Organismus hervorgehen.

Ziel

A major challenge in cognitive neuroscience is to understand how behaviour arises from the dynamical interaction of an organism’s nervous system, its body, and its environment. Understanding embodied neural activity involves the resolution of various conceptual, technical and methodological issues in explaining how living organisms self-organize at many levels (from neural bio-chemistry to behaviour and learning). Currently, two important obstacles hinder this endeavour: the difficulties in recording neural activity in behaving animals, and the lack of mathematical tools to characterize the complex brain-body-environment interactions in living organisms. In this project we will address current limits by implementing an interdisciplinary combination of novel animal behaviour neuroimaging setups and large-scale statistical methods, with the goal of recording and modelling whole-brain activity of locomoting vertebrates. We will study fictively swimming larval zebrafish during active behaviour in a pioneering experimental setup, recording neural activity utilizing light-sheet microscopy for calcium imaging in different virtual reality scenarios involving sensorimotor manipulations. In this setup, we will collect data from the distributed neural circuits that integrate sensory signals from the environment (exafferent input) and their own movements (reafferent input), as well as plastic processes of habituation to new sensorimotor contingencies. From this data, we will infer large-scale generative models (i.e. models capable of yielding synthetic data resembling the studied phenomena) of embodied neural circuits by complementing dynamical models and techniques from statistical mechanics with innovative information theoretic and Bayesian inference methods and approximations for very large systems in non-equilibrium and non-stationary conditions.

Koordinator

THE UNIVERSITY OF SUSSEX
Netto-EU-Beitrag
€ 212 933,76
Adresse
SUSSEX HOUSE FALMER
BN1 9RH Brighton
Vereinigtes Königreich

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Region
South East (England) Surrey, East and West Sussex Brighton and Hove
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
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Gesamtkosten
€ 212 933,76