From protein sequence to function – computational and experimental de-orphanization of uncharacterized enzymes in fungi

Projektinformationen

fORPHAN

ID Finanzhilfevereinbarung: 893122

DOI 10.3030/893122

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 11 März 2020

Startdatum 1 November 2020

Enddatum 20 Februar 2023

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten € 187 572,48

EU-Beitrag € 187 572,48

Koordiniert durch

RIJKSUNIVERSITEIT GRONINGEN
Netherlands

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (4)

MIBiG 3.0: a community-driven effort to annotate experimentally validated biosynthetic gene clusters

Autoren: Barbara R Terlouw, Kai Blin, Jorge C Navarro-Muñoz, Nicole E Avalon, Marc G Chevrette, Susan Egbert, Sanghoon Lee, David Meijer, Michael J J Recchia, Zachary L Reitz, Jeffrey A van Santen, Nelly Selem-Mojica, Thomas Tørring, Liana Zaroubi, Mohammad Alanjary, Gajender Aleti, César Aguilar, Suhad A A Al-Salihi, Hannah E Augustijn, J Abraham Avelar-Rivas, Luis A Avitia-Domínguez, Francisco Barona
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 51(D1), 2022, Seite(n) D603–D610, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac1049

Current State and Future Directions of Genetics and Genomics of Endophytic Fungi for Bioprospecting Efforts

Autoren: Sagita, Rosa Quax, Wim J Haslinger, Kristina
Veröffentlicht in: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Ausgabe vol. 9, 2021, Seite(n) 649906, ISSN 2296-4185
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fbioe.2021.649906

Structural characterization and extended substrate scope analysis of two Mg2+-dependent O-methyltransferases from bacteria

Autoren: Sokolova, Nika; Zhang, Lili; Deravi, Sadaf; Oerlemans, Rick; Mathew, Groves R; Haslinger, Kristina
Veröffentlicht in: ChemBioChem, Ausgabe 24(9), 2023, Seite(n) e202300076, ISSN 1439-7633
Herausgeber: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1101/2023.01.28.526015

Striving for sustainable biosynthesis: discovery, diversification, and production of antimicrobial drugs in Escherichia coli

Autoren: Iacovelli, Riccardo; Sokolova, Nika; Haslinger, Kristina
Veröffentlicht in: Biochemical Society Transactions, Ausgabe 50(5), 2022, Seite(n) 1315–1328, ISSN 0300-5127
Herausgeber: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/BST20220218

Conference proceedings (1)

Engineering a plant polyketide synthase for the biosynthesis of methylated flavonoids.

Autoren: Peng B, Zhang L, He S, Oerlemans R, Quax WJ, Groves MR, and Haslinger, K
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.10.02.510496