Descripción del proyecto
Perspectiva estructural sobre la regulación de la expresión génica
La expresión génica de las células eucariotas está dirigida por una compleja combinación de factores que incluyen potenciadores y represores, así como modificaciones del ADN y de la accesibilidad de la cromatina. La organización de estos factores parece admitir de forma sólida acontecimientos aleatorios, como el daño del ADN y la acción del mecanismo de reparación del ADN. El proyecto financiado con fondos europeos EPIDNA se centrará en el papel de las modificaciones del ADN en patrones del nucleosoma, así como la comunicación cruzada entre la regulación de la transcripción y el estrés oxidativo. El objetivo es comprender el ajuste de los parámetros que dirigen la expresión génica, ayudando a arrojar luz sobre una multitud de procesos como el desarrollo embrionario y la determinación del destino celular.
Objetivo
In eukaryotic cells, gene expression is regulated by a complex interplay between a number of factors, from large-scale chromatin accessibility to inducible enhancers or repressors to local DNA modifications, changes in nucleosome architecture and specific histone markers. These finely tuned factors coordinate embrional development, response to stimuli and changes in cell fate. At the same time, this regulatory network has to robustly accommodate random events, most notably the presence of DNA damage and the action of DNA repair factors. While recent reports suggest this interplay is not always smooth, our mechanistic understanding of the underlying processes is severely limited, highlighting the need for quantitative approaches that will yield predictive models.
In this proposal, I plan to investigate three aspects of this interplay that recently came into the spotlight. Firstly, an integrative computational and experimental approach will be used to quantify the positioning effect resulting from a range of common DNA modifications: regulatory base variants that can be used to enforce specific nucleosome patterns, and damage byproducts that would thereby interfere with DNA repair through altered exposure to the environment. Secondly, a number of transcription factors will be systematically assessed to detect ones sensitive to the presence of the most common oxidative lesion, 8-oxoguanine, to identify possible direct cross-talk between oxidative stress and transcriptional regulation at oxidative hot spots. Finally, a multiscale quantum/classical study will explore the thermodynamics, mechanism of formation and possible nucleosomal locations of covalent histone-DNA cross-links that were recently postulated to both mediate the regulatory role of 5-formylcytosine and accelerate strand scission at abasic sites.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias físicas termodinámica
- ciencias naturales ciencias biológicas genética epigenética
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMA PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2019
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
08028 BARCELONA
España
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.