Opis projektu
Aspekty strukturalne regulacji ekspresji genów
Za ekspresję genów w komórkach eukariotycznych odpowiada złożona relacja różnych czynników, takich jak wzmacniacze i represory, dostępność chromatyny i modyfikacje DNA. Czynniki te w dużej mierze odpowiedzialne są także za inne zdarzenia, na przykład uszkodzenie DNA czy działanie mechanizmu naprawy DNA. Zespół finansowanego ze środków UE projektu EPIDNA postara się określić wpływ modyfikacji DNA na strukturę nukleosomu oraz poznać zależność pomiędzy stresem oksydacyjnym a regulacją transkrypcji. Celem naukowców jest wyjaśnienie regulacji parametrów odpowiedzialnych za ekspresję genów, co w rezultacie poszerzy dostępną wiedzę na temat wielu różnych procesów, takich jak embriogeneza czy determinowanie losów komórki.
Cel
In eukaryotic cells, gene expression is regulated by a complex interplay between a number of factors, from large-scale chromatin accessibility to inducible enhancers or repressors to local DNA modifications, changes in nucleosome architecture and specific histone markers. These finely tuned factors coordinate embrional development, response to stimuli and changes in cell fate. At the same time, this regulatory network has to robustly accommodate random events, most notably the presence of DNA damage and the action of DNA repair factors. While recent reports suggest this interplay is not always smooth, our mechanistic understanding of the underlying processes is severely limited, highlighting the need for quantitative approaches that will yield predictive models.
In this proposal, I plan to investigate three aspects of this interplay that recently came into the spotlight. Firstly, an integrative computational and experimental approach will be used to quantify the positioning effect resulting from a range of common DNA modifications: regulatory base variants that can be used to enforce specific nucleosome patterns, and damage byproducts that would thereby interfere with DNA repair through altered exposure to the environment. Secondly, a number of transcription factors will be systematically assessed to detect ones sensitive to the presence of the most common oxidative lesion, 8-oxoguanine, to identify possible direct cross-talk between oxidative stress and transcriptional regulation at oxidative hot spots. Finally, a multiscale quantum/classical study will explore the thermodynamics, mechanism of formation and possible nucleosomal locations of covalent histone-DNA cross-links that were recently postulated to both mediate the regulatory role of 5-formylcytosine and accelerate strand scission at abasic sites.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne termodynamika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka epigenetyka
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2019
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
08028 Barcelona
Hiszpania
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.