Deciphering different layers of regulation of FLOWERING LOCUS D, a bZIP transcription factor that promotes flowering of Arabidopsis

Información del proyecto

FD Net

Identificador del acuerdo de subvención: 894969

DOI

10.3030/894969

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 26 Marzo 2020

Fecha de inicio 1 Septiembre 2021

Fecha de finalización 31 Agosto 2023

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total

€ 174 806,40

Aportación de la UE

€ 174 806,40

Coordinado por

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Germany

Descripción del proyecto

Información molecular sobre la regulación de la transición floral en las plantas

El proceso por el que las plantas pasan del crecimiento vegetativo al reproductivo se denomina transición floral. El estímulo de la floración proviene del gen Flowering Locus T (FT), que reprograma la transcripción de los genes de identidad floral e induce así la floración. El proyecto financiado con fondos europeos FD Net tiene como objetivo ofrecer un conocimiento más exhaustivo del proceso de transición floral en la planta modelo «Arabidopsis thaliana» al centrarse en el factor de transcripción clave Flowering Locus D (FD) y su red transcriptómica. La investigación de los pasos reguladores que controlan la actividad del FD, como las modificaciones postraduccionales, ayudará a descifrar la función del FD y aportará conocimientos fundamentales sobre la transición floral en las plantas.

Objetivo

Floral transition denotes the initiation of plant reproduction. Several genetic pathways regulate this important transition and many of them converge on the regulation of FLOWERING LOCUS T (FT), the systemic flowering signal that moves from leaves to the shoot apex. FT reprograms transcription at the shoot apex by contributing to Florigen Activation Complex (FAC). A central component of this complex is the bZIP transcription factor FLOWERING LOCUS D (FD), which is responsible for DNA binding and gene specific regulation by the complex. I will employ single-cell RNA sequencing to capture the transient cell state where the FAC complex and two different target genes, APETALA1 and SOC1, are coexpressed. Defining the transcriptomic network of FD at the single-cell level will provide a deeper understanding of this dynamic process. Phosphorylation of a threonine residue in the SAP motif at the C terminus of FD is a key step in formation of the complex. Phosphomimetic or non-phosphorylatable FD SAP motif versions have opposite effects on FD function, being able or not, respectively, to complement the late flowering phenotype of fd-3. I will investigate whether SAP motif phosphorylation affects FD protein stability or impairs its protein-protein interactions using confocal microscopy and protein mass spectrometry. In addition, other bZIPs closely related to FD are phosphorylated at other sites, but no analysis of FD phosphorylation sites other than the SAP motif has been presented. I will map post-translational modifications of FD, which may reveal new regulatory steps in controlling FD activity. I will explore the ability of FD to form protein complexes with other transcription factors by employing yeast-two hybrid, protein pull-downs and interaction studies using immunoprecipitation-mass spectrometry and biotin-based proximity labeling. The identification of new FD protein interactors will start reverse genetic and biochemical approaches to better understand FD function.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

• ciencias naturales › ciencias biológicas › bioquímica › biomoléculas › proteínas › proteómica
• ciencias naturales › ciencias biológicas › genética › ADN
• ciencias naturales › ciencias biológicas › genética › ARN › transcriptomas
• ciencias naturales › ciencias físicas › óptica › microscopía › microscopía confocal
• ciencias naturales › ciencias químicas › química analítica › espectrometría de masas

Palabras clave

• Flowering
• Post-translational modifications
• Protein-protein interaction
• Single-cell transcriptomics

Programa(s)

• H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions PROGRAMA PRINCIPAL
  
• H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
  

Tema(s)

• MSCA-IF-2019 - Individual Fellowships
  

Régimen de financiación

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Convocatoria de propuestas

H2020-MSCA-IF-2019

Coordinador

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV

• Aportación neta de la UEn: € 174 806,40
• Dirección: HOFGARTENSTRASSE 8 ; 80539 MUNCHEN ; Alemania
• Región: Bayern › Oberbayern › München, Kreisfreie Stadt
• Tipo de actividad: Research Organisations
• Coste total: € 174 806,40