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Deciphering different layers of regulation of FLOWERING LOCUS D, a bZIP transcription factor that promotes flowering of Arabidopsis

Descrizione del progetto

Approfondimento molecolare sulla regolazione della transizione floreale nelle piante

Il processo mediante il quale le piante passano dalla crescita vegetativa a quella riproduttiva è noto come transizione floreale. Lo stimolo della fioritura proviene dal gene Flowering Locus T (FT), che riprogramma la trascrizione dei geni dell’identità floreale, inducendo così la fioritura. Il progetto FD Net, finanziato dall’UE, mira a fornire una comprensione più profonda del processo di transizione floreale nella pianta modello Arabidopsis thaliana, concentrandosi sul fattore di trascrizione chiave Flowering Locus D (FD) e sulla sua rete trascrittomica. Lo studio delle fasi regolatorie che controllano l’attività di FD, comprese le modifiche post-traduzionali, aiuterà a decifrare la funzione di FD e fornirà conoscenze fondamentali sulla transizione floreale nelle piante.

Obiettivo

Floral transition denotes the initiation of plant reproduction. Several genetic pathways regulate this important transition and many of them converge on the regulation of FLOWERING LOCUS T (FT), the systemic flowering signal that moves from leaves to the shoot apex. FT reprograms transcription at the shoot apex by contributing to Florigen Activation Complex (FAC). A central component of this complex is the bZIP transcription factor FLOWERING LOCUS D (FD), which is responsible for DNA binding and gene specific regulation by the complex. I will employ single-cell RNA sequencing to capture the transient cell state where the FAC complex and two different target genes, APETALA1 and SOC1, are coexpressed. Defining the transcriptomic network of FD at the single-cell level will provide a deeper understanding of this dynamic process. Phosphorylation of a threonine residue in the SAP motif at the C terminus of FD is a key step in formation of the complex. Phosphomimetic or non-phosphorylatable FD SAP motif versions have opposite effects on FD function, being able or not, respectively, to complement the late flowering phenotype of fd-3. I will investigate whether SAP motif phosphorylation affects FD protein stability or impairs its protein-protein interactions using confocal microscopy and protein mass spectrometry. In addition, other bZIPs closely related to FD are phosphorylated at other sites, but no analysis of FD phosphorylation sites other than the SAP motif has been presented. I will map post-translational modifications of FD, which may reveal new regulatory steps in controlling FD activity. I will explore the ability of FD to form protein complexes with other transcription factors by employing yeast-two hybrid, protein pull-downs and interaction studies using immunoprecipitation-mass spectrometry and biotin-based proximity labeling. The identification of new FD protein interactors will start reverse genetic and biochemical approaches to better understand FD function.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 174 806,40
Indirizzo
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 MUNCHEN
Germania

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Regione
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 174 806,40
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