Description du projet
Le microbiote et le transfert horizontal de gènes
Les microbes sont connectés au système immunitaire, c’est pourquoi le fait de modifier la composition et la fonction du microbiote intestinal (MI) pourrait améliorer la santé. Changer la représentation des espèces par le biais de modifications alimentaires ou du mode de vie peut s’avérer difficile en raison des faibles effets des facteurs qui influencent la composition du MI. La sélection de l’hôte et la concurrence entre les microbes résidents limitent la greffe de la souche, nécessaire pour que les transferts fécaux et les cocktails probiotiques soient efficaces. L’objectif du projet MiMoZa, financé par l’UE, consiste à déterminer les taux de transfert horizontal de gènes (THG) de fonctions spécifiques au sein du microbiote intestinal. Les chercheurs entendent déterminer les taux de THG dans l’intestin animal en conditions naturelles et améliorées par le THG. Ils prévoient de mettre au point des méthodes pour examiner le THG dans des ensembles de données métagénomiques et déterminer l’importance relative des facteurs qui influencent le THG.
Objectif
My goal is to determine horizontal gene transfer (HGT) rates of specific functions within the gut microbiome. The microbes on and within our bodies, especially within our gastro-intestinal tract, are intimately connected with our immune system and promote health in myriad ways. Altering our gut microbiota (GM) composition and/or function might thus improve health. My research in the Jeroen Raes lab led to the realization that changing species abundances through dietary or lifestyle modulation may be difficult because of the small effect sizes of the factors influencing GM composition (e.g. diet, medication, or transit time). In addition, host-selection and competition of resident microbes, might limit the strain engraftment necessary for the effect of fecal transfers and probiotic cocktails. Despite initial successes (e.g. C. difficile infection treatment), current modulation strategies might therefore be less successful with other conditions. I contacted Ilana Brito, in order to find out whether HGT - a process in which prokaryotes exchange genetic material - may serve as an alternative way to modulate the residing GM. Little is known about the features that affect HGT rates within natural environments nor the role of selection in that process. If these were well-understood, it would allow to assess the possibilities of extending the gut microbiome with additional functions. During my research stay, I will experimentally determine HGT rates within the animal gut under natural and HGT-enhancing conditions. In addition, I will develop methods to examine HGT in metagenomic datasets and determine the relative importance of the factors influencing HGT (selective pressure, host health and DNA delivery method). The knowledge generated through this MSCA-fellowship will stimulate the development of novel GM modulation strategies and will have important implications for human health and agricultural policies (e.g. antibiotic use, spread of transgenes).
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé biotechnologie médicale génie génétique thérapie génique
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé nutrition
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.