Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Microbiota modulation through horizontal gene transfer.

Opis projektu

Mikroflora a poziomy transfer genów

Drobnoustroje powiązane są z układem odpornościowym, a zmiana składu i czynności mikroflory jelitowej może pozytywnie wpływać na zdrowie. Modyfikacja składu mikroflory jelitowej poprzez zmianę diety lub stylu życia może być trudna ze względu na niewielki wpływ, jaki mają na niego te czynniki. Wybór gospodarza i współzawodnictwo bytujących w jego organizmie drobnoustrojów ogranicza możliwość zaszczepienia w nim danego szczepu niezbędnego do osiągnięcia rezultatów przeszczepu kału i stosowania koktajli probiotycznych. Celem finansowanego ze środków UE projektu MiMoZa jest określenie wskaźników poziomego transferu genów dla poszczególnych funkcji w obrębie mikroflory jelitowej. Naukowcy dążą do określenia wskaźników poziomego transferu genów w jelitach zwierząt w warunkach naturalnych i sprzyjających temu procesowi. Planują oni opracować metody badania poziomego transferu genów w metagenomicznych zbiorach danych i określić względne znaczenie wpływających na niego czynników.

Cel

My goal is to determine horizontal gene transfer (HGT) rates of specific functions within the gut microbiome. The microbes on and within our bodies, especially within our gastro-intestinal tract, are intimately connected with our immune system and promote health in myriad ways. Altering our gut microbiota (GM) composition and/or function might thus improve health. My research in the Jeroen Raes lab led to the realization that changing species abundances through dietary or lifestyle modulation may be difficult because of the small effect sizes of the factors influencing GM composition (e.g. diet, medication, or transit time). In addition, host-selection and competition of resident microbes, might limit the strain engraftment necessary for the effect of fecal transfers and probiotic cocktails. Despite initial successes (e.g. C. difficile infection treatment), current modulation strategies might therefore be less successful with other conditions. I contacted Ilana Brito, in order to find out whether HGT - a process in which prokaryotes exchange genetic material - may serve as an alternative way to modulate the residing GM. Little is known about the features that affect HGT rates within natural environments nor the role of selection in that process. If these were well-understood, it would allow to assess the possibilities of extending the gut microbiome with additional functions. During my research stay, I will experimentally determine HGT rates within the animal gut under natural and HGT-enhancing conditions. In addition, I will develop methods to examine HGT in metagenomic datasets and determine the relative importance of the factors influencing HGT (selective pressure, host health and DNA delivery method). The knowledge generated through this MSCA-fellowship will stimulate the development of novel GM modulation strategies and will have important implications for human health and agricultural policies (e.g. antibiotic use, spread of transgenes).

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2019

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

VIB VZW
Wkład UE netto
€ 266 425,92
Koszt całkowity
€ 266 425,92

Partnerzy (1)