Descrizione del progetto
Un approccio metagenomico per studiare l’evoluzione dei microbi selvatici
Una goccia di acqua di mare contiene un’ampia rappresentanza dei microbi marini di tutto il mondo. Gli studi sulla genetica della popolazione potrebbero rivelare maggiori informazioni sull’ecologia e l’evoluzione dei microbi marini. Inoltre, l’indagine sul processo evoluzionistico dei microbi selvatici nell’ambiente naturale offre risultati che differiscono molto da quelli provenienti dagli esperimenti di laboratorio. La conoscenza è fondamentale per comprendere quanto i microbi rilevanti dal punto di vista globale rispondono ai cambiamenti climatici. Il progetto WildE, finanziato dall’UE, si propone di quantificare il tasso di evoluzione negli assemblaggi naturali di microbi marini, combinando la metagenomica ai dati dell’analisi di serie temporali. L’esplorazione di microbi selvatici potrebbe rivelare modelli evoluzionistici che emergono come conseguenza della complessità dell’ecosistema e dei cambiamenti globali. Inoltre, potrebbe fornire nuovi spunti sull’impatto del trasferimento genico orizzontale, della ricombinazione e delle infezioni virali sulla composizione del genoma di varie specie.
Obiettivo
During the last two decades, there has been a huge increase in our knowledge of microbial diversity, phylogeny and genomics. However, we have limited knowledge on microbial population genetics and microevolution of wild microbes. Knowing the rate of evolution of wild microbes in the natural environment is crucial if we are to understand and predict how ecologically important marine microbes will cope as the oceans continue to change under global climate change. Laboratory experiment have been been useful for exploring the mechanisms of evolution in microbes. Yet, as a consequence of complex and variable biotic and abiotic interactions, the evolutionary process in ecosystems may be substantially different from what has been observed in lab experiments featuring relatively constant and simple environments. The next step to increase our understanding of microbial evolution is to investigate evolution of wild microbes in the natural environment. WildE aims to quantify the rate of evolution in wild marine microbes, using metagenomic time-series data (monthly samples over 7 years: 2009-2015). In addition, WildE will quantify the rate of evolution in natural assemblages of marine microbes, under selection pressure (elevated temperature) and measure how environmental selection changes population structure using an enclosed mesocosm experiment. Using both field investigations and mesocosm experiments will strengthen our understanding of evolutionary dynamics of wild populations. Exploring wild microbes will most likely reveal novel evolutionary patterns emerging as a consequence of ecosystem complexity, providing hints on the impact of horizontal gene transfer, recombination and viral infections on the genome composition of different species. The data produced here will be of interest to both scientists and policy makers and will increase our understanding of how ecologically important marine microbes will respond to future global change.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
- scienze naturaliscienze biologichegenetica
- scienze naturaliscienze biologichemorfologia biochimicamorfologia comparativa
- scienze naturaliscienze biologicheecologiaecosistemi
È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione
Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
28006 Madrid
Spagna