Projektbeschreibung
Echtzeitstudie zur Chromosomeninstabilität bei Krebs
Vielen genomische Aberrationen wurzeln in Fehlern bei der Zellteilung, bei denen die DNA normalerweise gleichmäßig auf beide Tochterzellen aufgeteilt wird. Es bestehen Lücken im Verständnis hinsichtlich der genetischen Konsequenzen mitotischer Fehler bei der Tumorentstehung sowie genomischer Instabilität. Patienteneigene Tumororganoide und modernste Forschungstechniken, die eine direkte mikroskopische Beobachtung der Mitose und eine Einzelzell-Gesamtgenomsequenzierung kombinieren, bieten die Möglichkeit, diese grundlegenden Fragen zu untersuchen. Das EU-finanzierte Projekt OCIC untersucht als Modellsystem das Auftreten und die Aufrechterhaltung genomischer Instabilität unter Verwendung von Organoiden, die von Betroffenen mit Adenokarzinom des Ösophagus (EAC) stammen. Insbesondere die EAC-Genome zeigen genomische Katastrophen, welche die Tumorentstehung vorantreiben könnten. Letztendlich will die Studie die Technologie auf eine Gruppe menschlicher Tumororganoide anwenden, die aus verschiedenen Geweben stammen.
Ziel
Genomes from tumor cells are often grossly derailed in DNA content, with chromosomes gained, lost, fused or otherwise rearranged. Presumably, many of these aberrations stem from mistakes during cell division, during which the DNA is normally divided equally to both daughter cells. Cell division is often studied microscopically in 2D cell culture, while DNA sequences from cancer genomes are often re-constructed from tumor patient material. As a consequence, there is still a poor understanding regarding the direct genetic consequences of mitotic errors and as such, genomic instability. Patient-derived tumor organoids, in combination with cutting-edge technology that combines direct microscopic observation of mitotic events, with single-cell whole genome sequencing (scWGS), provide a unique opportunity to tackle these fundamental questions.
To understand the occurrence and maintenance of genomic instability, I will study organoids derived from esophageal adenocarcinoma (EAC) patients. While observed in many cancers, EAC genomes in particular show genomic catastrophes and are thought to drive tumorigenic transformation. Cells will be filmed in real-time to detect mitotic errors. Daughter cells from erroneous divisions will be photoconverted, allowing single cell tracking and isolation for prospective genetic analysis. scWGS will detect imbalances in chromosome number and/or structural rearrangements between the paired daughter cells. Genetic aberrations can be directly linked to the observed mitotic error and cell fate across multiple divisions to understand its role in tumorigenesis.
To couple molecular mechanisms to genetic footprints, fluorescent markers will be implemented to interrogate the type of DNA damage missegregated chromosomes receive, how this affects the subsequent cell cycles, and how this missegregated DNA is re-incorporated into the genome. Finally, I will test these findings across a panel of human tumor organoids derived from different tissues.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie Prostatakrebs
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2019
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
3584 CX Utrecht
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.