Descrizione del progetto
Meccanismi epigenetici contribuiscono alla resistenza alla terapia nel melanoma
Si pensa che la resistenza ai farmaci antitumorali si verifichi principalmente a causa di alterazioni genetiche. Alcune prove recenti indicano che possa essere inoltre acquisita in assenza di cambiamenti genetici. Non è chiaro se i meccanismi genetici o non genetici della resistenza siano selezionati in modo stocastico né quali siano i meccanismi epigenetici alla base della transizione dalla tolleranza alla resistenza ai farmaci. Il progetto EscaPI, finanziato dall’UE, si propone di identificare le sottopopolazioni tolleranti ai farmaci che guidano la resistenza non genetica attraverso tracciamento del lignaggio ed esperimenti di riduzione in modelli preclinici. Il progetto sfrutterà le moderne tecnologie di barcoding in vivo e approcci multiomici a singola cellula, fornendo una visione dinamica e integrata dell’evoluzione di profili epigenomici con una risoluzione di singola cellula. Inoltre, esso cercherà biomarcatori predittivi per valutare la percentuale di pazienti con melanoma che manifestano una resistenza non genetica attraverso una combinazione di sequenziamento multiplexato del DNA con colorazione e mirato.
Obiettivo
Resistance to anticancer drugs, which often develops from a heterogeneous pool of drug-tolerant cells known as minimal residual disease (MRD), is thought to mainly occur through acquisition of genetic alterations. Emerging evidence indicates that drug resistance may also be acquired in absence of a genetic cause. It remains unclear, however, whether genetic versus non-genetic mechanisms of resistance are selected in a stochastic manner, and what are the epigenomics mechanisms underlying the transition from drug-tolerance to resistance. This project aims at identifying the drug-tolerant subpopulation(s) that drive non-genetic resistance by performing lineage tracing and depletion experiments in pre-clinical models. Taking advantage of up-to-date technologies combining in vivo barcoding and single-cell multi-omics approaches, this project aims to provide a dynamic and integrated view of the evolution of epigenomic profiles -at single-cell resolution- before, during and after acquisition of drug resistance phenotypes in a in vivo clinically-relevant context. A third objective of this proposal is to search for predictive biomarkers of non-genetic resistance and to assess the percentage of melanoma patients that undergo non-genetic resistance through combination of multiplexed staining and targeted DNA sequencing. The success of this project is ensured by my personal background in epigenetics and related data computational analysis, the achievements of the JCM lab in melanoma epigenetic reprogramming and the close collaborations with experts in single-cell multi-omics fields. I anticipate that my involvement in this project will broaden my skills and knowledge and help me become a high-qualified European independent scientist.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
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Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
9052 ZWIJNAARDE - GENT
Belgio