Description du projet
Une interaction entre les cellules tumorales, le microenvironnement tumoral et le système immunitaire
La progression du cancer est un processus complexe qui dépend de l’interaction entre les cellules tumorales, le microenvironnement tumoral et le système immunitaire. Afin de mieux comprendre la biologie de la tumeur et la réponse au traitement, il est nécessaire d’établir le profil de l’expression des protéines du système interconnecté entier. MIBI‑TOF est une technologie dans laquelle les anticorps conjugués aux métaux sont utilisés pour visualiser de manière simultanée des dizaines de protéines dans des échantillons de tissus intacts grâce à la spectrométrie de masse d’ions secondaires. Le projet MelImmuneOrg, financé par l’UE, entend dévoiler le profil et l’organisation immunitaires dans les tumeurs de patients atteints d’un mélanome et subissant une immunothérapie avec MIBI‑TOF. Les objectifs consistent à analyser l’hétérogénéité intratumorale et les corrélations génétiques entre la tumeur, le microenvironnement immunitaire et la réponse au traitement.
Objectif
Cancer progression is a complex process that depends on the interplay between tumor cells, tumor microenvironment, and the immune system. Inhibiting immunosuppression is beneficial for cancer patients. Although these therapies are promising they are successful only in part of the patients. Tumors are composed of distinct cell types with different phenotypes, that influence the efficacy of immunotherapies. Therefore, in order to better understand tumor biology and response to treatment, it is necessary to profile protein expression while preserving spatial information. Multiplexed Ion Beam Imaging by Time of Flight (MIBI-TOF) is a method in which antibodies conjugated to metals are used to simultaneously visualize dozens of proteins in intact tissue specimens by secondary ion mass spectrometry. Here we suggest to uncover the immune profile and organization within the tumors of melanoma patients undergoing immunotherapy using MIBI-TOF. My first objective is to characterize the tumor-immune microenvironments to understand how these are structured across patients and discover predictive features of response to immunotherapies. My second objective is to analyze the intratumor heterogeneity (ITH) of melanoma patients by exome sequencing. I will examine whether there are genetic correlates between ITH, immune microenvironment and response to therapy. Finally, my third objective will be the manipulation of individual hits to test their functional significance in tumor-immune architecture in murine models. By joining Dr. Keren’s lab that masters the MIBI-TOF technology, I will acquire this state-of-the art technique, as well as develop lab management and organization skills, and I will meet leader scientists from the immune-oncology field. This proposal will promote my competitiveness to gain an independent researcher position.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Mots‑clés
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
7610001 Rehovot
Israël