Description du projet
Faire le lien entre le noyau et l’autophagie dans la défense des plantes
L’autophagie est un mécanisme majeur de renouvellement de la cellule qui élimine les composants cellulaires endommagés ou redondants chez les eucaryotes. Il s’agit d’un mécanisme de défense des plantes contre les agents pathogènes qui pourrait ouvrir de nouvelles voies dans l’amélioration de la résistance des cultures aux maladies. La recherche sur l’autophagie végétale a, dans un premier temps, mis l’accent sur les mécanismes et les cibles cytoplasmiques. Cependant, la dégradation des composants nucléaires et la régulation épigénétique de l’autophagie ont récemment suscité une attention accrue en ce qui concerne les systèmes de levure et de mammifères. Le projet NUCLAGY, financé par l’UE, s’appuie sur des conclusions de recherche selon lesquelles plusieurs isoformes de la protéine d’autophagie centrale 8 (ATG8) d’Arabidopsis se localisent dans des composants nucléaires distincts. Le projet identifiera les interactomes nucléaires de l’ATG8 dans des conditions physiologiques et pathologiques par affinité-immunoprécipitation et analyse de spectrométrie de masse. La caractérisation des interactomes devrait permettre de découvrir de nouveaux régulateurs et de nouvelles cibles nucléaires de l’autophagie, avec des implications pour la défense des plantes et l’amélioration des cultures.
Objectif
Autophagy is a major degradation and renewal system that controls cellular homeostasis and stress adaptation in eukaryotes. Emerging evidence indicates that autophagy is an integral part of the plant’s defence against pathogens and thus, a promising target to improve disease resistance in crops. Research on plant autophagy has primarily focused on cytoplasmic targets and mechanisms, yet the degradation of nuclear components (nucleophagy) and the epigenetic regulation of autophagy have recently received growing attention in yeast and mammalian systems. Whether nuclear events are of similar importance for plant autophagy is unknown and therefore, the major question to be addressed in this project. The proposed research builds on my key finding that several isoforms of the Arabidopsis core autophagy protein 8 (ATG8) localize to distinct nuclear compartments. I aim to identify the nuclear ATG8 interactomes at normal and virus-induced conditions by affinity-immunoprecipitation and mass spectrometry analysis. Candidate interactors will be functionally analysed for their potential role as transcriptional/epigenetic regulators, cargo receptors, and nucleophagic substrates in response to Cauliflower mosaic virus and Cabbage leaf curl virus. I will also investigate how these pathogens intersect with nuclear functions to manipulate cytoplasmic events of autophagy during infection. The proposed project will be carried out at the Swedish University of Agricultural Sciences under supervision of Prof. Daniel Hofius, a leading scientist and expert in plant autophagy and immunity. Hence, the project provides an excellent opportunity to expand my knowledge and experience to autophagy, while the host lab will benefit from my strong expertise in plant virology and epigenetics. Together, this synergistic effort will reveal fundamental insights into the nuclear dynamics of autophagy in plant immunity, and uncover novel autophagic mechanisms for crop improvement.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. La classification de ce projet a été validée par l’équipe qui en a la charge.
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- sciences naturellessciences biologiquesbiologie cellulaire
- sciences agricolesagriculture, sylviculture et pêcheagriculture
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- sciences naturellessciences biologiquesgénétiqueépigénétique
Mots‑clés
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
750 07 Uppsala
Suède