Skip to main content
Ir a la página de inicio de la Comisión Europea (se abrirá en una nueva ventana)
español español
CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS

Single Cell EPigenomic, Transcriptomic, and structural Rearrangement profiling to investigate Evolution in prostate cancer

Descripción del proyecto

Evolución del cáncer de próstata

El cáncer de próstata se caracteriza por una extensa heterogeneidad molecular y clínica. El objetivo del proyecto SCEPTRE, financiado con fondos europeos, es comprender la función de la epigenética en la heterogeneidad de los tumores y la evolución clonal. Para ello, los científicos utilizarán tecnologías de secuenciación punta para identificar las variaciones epigenéticas, transcriptómicas y genómicas en las células cancerosas. Los factores impulsores epigenéticos y la metilación del ADN pueden servir como biomarcadores y proporcionar información sobre la evolución de diferentes clones de cáncer. Teniendo en cuenta que el cáncer de próstata es el cáncer más diagnosticado en hombres en Europa, los resultados del proyecto tendrán una gran importancia clínica y terapéutica.

Objetivo

Prostate cancer (PrCa) is the most frequently diagnosed cancer in men in the European Union (EU), and is a molecularly and clinically heterogeneous disease. Although the genomic and transcriptomic landscapes of PrCa have been characterized deeply, the genome-wide epigenetic landscape and its contribution to tumor heterogeneity has received less attention. The lack of single-cell methylation (with parallel single-cell transcriptomic) datasets in solid tumors (and none in PrCA) has stunted inference on clonal evolution. Consequently, the understanding of the coordinated relationship between methylation and transcriptome remains tenuous at best. Structural variants have also not been able to be accurately resolved in cancer due to the reliance on short-read sequencing, and their interplay with DNA methylation is still poorly understood. I present the project, SCEPTRE which is tightly connected to and builds upon ample expertise in the laboratories of Prof. Christoph Plass, Division Chair of Cancer Epigenomics, DKFZ, and Dr. Oliver Stegle, Division Chair of Computational Genomics, DKFZ. Within this project, I will drive the generation of novel ‘single-cell’ and ‘single-molecule long-read’ PrCa datasets, and exploit existing data resources to comprehensively assess the epigenetic and joint transcriptomic and genomic dimensions of human PrCa with the aim to examine cancer evolution. To realize this aim, I will also derive a comprehensive computational toolbox for the analysis of single-cell (and single-molecule) DNA methylation and joint multi-omic profiles. This project will deliver novel innovative ways to identify epigenetic drivers; as well as link DNA methylation for lineage tracing as a biomarker for disease progression. Moreover, the project will uncover putative relationships between the DNA methylome and transcriptome as well as between structural genetic aberrations and epigenetic changes.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse

Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2019

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

DEUTSCHES KREBSFORSCHUNGSZENTRUM HEIDELBERG
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 174 806,40
Dirección
IM NEUENHEIMER FELD 280
69120 Heidelberg
Alemania

Ver en el mapa

Región
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 174 806,40
Mi folleto 0 0