Multiscale Dynamics with Ultrafast High-Resolution Relaxometry

Información del proyecto

HIRES-MULTIDYN

Identificador del acuerdo de subvención: 899683

DOI

10.3030/899683

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 27 Mayo 2020

Fecha de inicio 1 Octubre 2020

Fecha de finalización 30 Septiembre 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Coste total

€ 3 284 779,99

Aportación de la UE

€ 3 284 779,99

Coordinado por

ECOLE NORMALE SUPERIEURE
France

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Resultado final

Documents, reports (1)

Report on correReport on correlation functions for motions with and without geometric restrictions

Report developped on correlation functions for motions with or without geometric restrictions

Publicaciones

Peer reviewed articles (20)

Paramagnetic Nuclear Magnetic Resonance: The Toolkit

Autores: Leonardo Querci, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera, Mario Piccioli
Publicado en: Inorganics, Edición 12, 2025, Página(s) 15, ISSN 2304-6740
Editor: MDPI AG
DOI: 10.3390/inorganics12010015

Detection of Metabolite–Protein Interactions in Complex Biological Samples by High-Resolution Relaxometry: Toward Interactomics by NMR

Autores: Ziqing Wang, Simone Pisano, Veronica Ghini, Pavel Kadeřávek, Milan Zachrdla, Philippe Pelupessy, Morgan Kazmierczak, Thorsten Marquardsen, Jean-Max Tyburn, Guillaume Bouvignies, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Fabien Ferrage
Publicado en: Journal of the American Chemical Society, Edición 143/25, 2021, Página(s) 9393-9404, ISSN 0002-7863
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c01388

A Quantum Chemistry View on Two Archetypical Paramagnetic Pentacoordinate Nickel(II) Complexes Offers a Fresh Look on Their NMR Spectra

Autores: Enrico Ravera, Lucia Gigli, Barbara Czarniecki, Lucas Lang, Rainer Kümmerle, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Frank Neese, Claudio Luchinat
Publicado en: Inorganic Chemistry, Edición 60/3, 2021, Página(s) 2068-2075, ISSN 0020-1669
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.0c03635

Molecular motions in olive oil from nuclear magnetic relaxation over five orders of magnitude of magnetic field

Autores: Giulia Licciardi, Letizia Fiorucci, Jorge A. Villanueva-Garibay, Olof Stenström, Enrico Ravera, Fabien Ferrage, Claudio Luchinat, Giacomo Parigi
Publicado en: Journal of Molecular Liquids, Edición 437, 2025, Página(s) 128538, ISSN 0167-7322
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.molliq.2025.128538

Deciphering the RNA recognition by Musashi-1 to design protein and RNA variants for <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i> applications

Autores: Anna Pérez-Ràfols, Guillermo Pérez-Ropero, Linda Cerofolini, Luca Sperotto, Joel Roca-Martínez, R Anahí Higuera-Rodríguez, Pasquale Russomanno, Wolfgang Kaiser, Wim Vranken, U Helena Danielson, Alessandro Provenzani, Tommaso Martelli, Michael Sattler, Jos Buijs, Marco Fragai
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 53, 2025, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf741

Theoretical analysis of the long-distance limit of NMR chemical shieldings

Autores: Lucas Lang, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Frank Neese
Publicado en: The Journal of Chemical Physics, Edición 156, 2025, ISSN 0021-9606
Editor: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0088162

Novel Nanogels Loaded with Mn(II) Chelates as Effective and Biologically Stable MRI Probes

Autores: Fabio Carniato, Marco Ricci, Lorenzo Tei, Francesca Garello, Chiara Furlan, Enzo Terreno, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Mauro Botta
Publicado en: Small, Edición 19, 2023, ISSN 1613-6810
Editor: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202302868

Phase distortion-free paramagnetic NMR spectra

Autores: Enrico Ravera
Publicado en: Journal of Magnetic Resonance Open, Edición 8-9, 2023, Página(s) 100022, ISSN 2666-4410
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jmro.2021.100022

How does it really move? Recent progress in the investigation of protein nanosecond dynamics by NMR and simulation

Autores: Olof Stenström, Candide Champion, Marc Lehner, Guillaume Bouvignies, Sereina Riniker, Fabien Ferrage
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, Edición 77, 2023, Página(s) 102459, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102459

Not only manganese, but fruit component effects dictate the efficiency of fruit juice as an oral magnetic resonance imaging contrast agent

Autores: G. Licciardi, D. Rizzo, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi, C. Luchinat
Publicado en: NMR in Biomedicine, Edición 35-2, 2021, Página(s) e4623, ISSN 1099-1492
Editor: Wiley Analytical Science
DOI: 10.1002/nbm.4623

Extracting Trends From NMR Data With TrAGICo: A Python Toolbox

Autores: Letizia Fiorucci, Francesco Bruno, Leonardo Querci, Adam Kubrak, Jlenia Bindi, Nebojša Rodić, Giulia Licciardi, Enrico Luchinat, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Enrico Ravera
Publicado en: Magnetic Resonance in Chemistry, Edición 63, 2025, Página(s) 628-654, ISSN 0749-1581
Editor: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5537

Combining Solid‐State NMR with Structural and Biophysical Techniques to Design Challenging Protein‐Drug Conjugates

Autores: Linda Cerofolini, Kristian Vasa, Elisa Bianconi, Maria Salobehaj, Giulia Cappelli, Alice Bonciani, Giulia Licciardi, Anna Pérez‐Ràfols, Luis Padilla‐Cortés, Sabrina Antonacci, Domenico Rizzo, Enrico Ravera, Caterina Viglianisi, Vito Calderone, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Antonio Macchiarulo, Stefano Menichetti, Marco Fragai
Publicado en: Angewandte Chemie, Edición 135, 2023, ISSN 0044-8249
Editor: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202303202

Field-dependent relaxation profiles of biomolecular systems

Autores: Adam Kubrak, Rajka Pejanovic, Kahinga Kamau, Danuta Kruk, Fabien Ferrage, Giacomo Parigi
Publicado en: Physical Chemistry Chemical Physics, Edición 27, 2025, Página(s) 1756-1771, ISSN 1463-9076
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cp04306e

Large Protein Assemblies for High-Relaxivity Contrast Agents: The Case of Gadolinium-Labeled Asparaginase

Autores: G. Licciardi, D. Rizzo, M. Salobehaj, L. Massai, A. Geri, L. Messori, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi
Publicado en: Bioconjugate Chemistry, Edición 33-12, 2022, Página(s) 2411–2419, ISSN 0020-1669
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00506

Iron Oxide Nanoparticles as Positive T1 Contrast Agents for Low-Field Magnetic Resonance Imaging at 64 mT

Autores: Samuel Oberdick, Kalina Jordanova, John Lundstrom, Giacomo Parigi, Megan Poorman, Gary Zabow, Kathryn Keenan
Publicado en: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2485292/v1

Sensitivity considerations on denoising series of spectra by singular value decomposition

Autores: Francesco Bruno, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera
Publicado en: Magnetic Resonance in Chemistry, Edición 61, 2023, Página(s) 373-379, ISSN 0749-1581
Editor: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5338

Engineered Nonviral Protein Cages Modified for MR Imaging

Autores: M.A. Kaster, M.D. Levasseur, T.G.W. Edwardson, M.A. Caldwell, D. Hofmann, G. Licciardi, G. Parigi, C. Luchinat, D. Hilvert, T.J. Meade
Publicado en: ACS Applied Bio Materials, Edición 6, 2023, Página(s) 591-602, ISSN 1520-5126
Editor: ACS
DOI: 10.1021/acsabm.2c00892

Revisiting paramagnetic relaxation enhancements in slowly rotating systems: how long is the long range?

Autores: Giovanni Bellomo, Enrico Ravera, Vito Calderone, Mauro Botta, Marco Fragai, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat
Publicado en: Magnetic Resonance, Edición 2/1, 2021, Página(s) 25-31, ISSN 2699-0016
Editor: Copernicus
DOI: 10.5194/mr-2-25-2021

Explicit Models of Motion to Understand Protein Side-Chain Dynamics

Autores: N. Bolik-Coulon, O. Languin-Cattoën, D. Carnevale, M. Zachrdla, D. Laage, F. Sterpone, G. Stirnemann, F. Ferrage
Publicado en: Physical review letters, Edición 129-20, 2022, Página(s) 203001, ISSN 0031-9007
Editor: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.129.203001

High Relaxivity with No Coordinated Waters: A Seemingly Paradoxical Behavior of [Gd(DOTP)]5– Embedded in Nanogels

Autores: F. Carniato, M. Ricci, L. Tei, F. Garello, E. Terreno, E. Ravera, G. Parigi, C. Luchinat, M. Botta
Publicado en: Inorganic Chemistry, Edición 61, 2022, Página(s) 5380–5387, ISSN 0020-1669
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.2c00225