Multiscale Dynamics with Ultrafast High-Resolution Relaxometry

Informations projet

HIRES-MULTIDYN

N° de convention de subvention: 899683

DOI

10.3030/899683

Projet clôturé

Date de signature de la CE 27 Mai 2020

Date de début 1 Octobre 2020

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Coût total

€ 3 284 779,99

Contribution de l’UE

€ 3 284 779,99

Coordonné par

ECOLE NORMALE SUPERIEURE
France

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Documents, reports (1)

Report on correReport on correlation functions for motions with and without geometric restrictions

Report developped on correlation functions for motions with or without geometric restrictions

Publications

Peer reviewed articles (20)

Paramagnetic Nuclear Magnetic Resonance: The Toolkit

Auteurs: Leonardo Querci, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera, Mario Piccioli
Publié dans: Inorganics, Numéro 12, 2025, Page(s) 15, ISSN 2304-6740
Éditeur: MDPI AG
DOI: 10.3390/inorganics12010015

Detection of Metabolite–Protein Interactions in Complex Biological Samples by High-Resolution Relaxometry: Toward Interactomics by NMR

Auteurs: Ziqing Wang, Simone Pisano, Veronica Ghini, Pavel Kadeřávek, Milan Zachrdla, Philippe Pelupessy, Morgan Kazmierczak, Thorsten Marquardsen, Jean-Max Tyburn, Guillaume Bouvignies, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Fabien Ferrage
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 143/25, 2021, Page(s) 9393-9404, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c01388

A Quantum Chemistry View on Two Archetypical Paramagnetic Pentacoordinate Nickel(II) Complexes Offers a Fresh Look on Their NMR Spectra

Auteurs: Enrico Ravera, Lucia Gigli, Barbara Czarniecki, Lucas Lang, Rainer Kümmerle, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Frank Neese, Claudio Luchinat
Publié dans: Inorganic Chemistry, Numéro 60/3, 2021, Page(s) 2068-2075, ISSN 0020-1669
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.0c03635

Molecular motions in olive oil from nuclear magnetic relaxation over five orders of magnitude of magnetic field

Auteurs: Giulia Licciardi, Letizia Fiorucci, Jorge A. Villanueva-Garibay, Olof Stenström, Enrico Ravera, Fabien Ferrage, Claudio Luchinat, Giacomo Parigi
Publié dans: Journal of Molecular Liquids, Numéro 437, 2025, Page(s) 128538, ISSN 0167-7322
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.molliq.2025.128538

Deciphering the RNA recognition by Musashi-1 to design protein and RNA variants for <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i> applications

Auteurs: Anna Pérez-Ràfols, Guillermo Pérez-Ropero, Linda Cerofolini, Luca Sperotto, Joel Roca-Martínez, R Anahí Higuera-Rodríguez, Pasquale Russomanno, Wolfgang Kaiser, Wim Vranken, U Helena Danielson, Alessandro Provenzani, Tommaso Martelli, Michael Sattler, Jos Buijs, Marco Fragai
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf741

Theoretical analysis of the long-distance limit of NMR chemical shieldings

Auteurs: Lucas Lang, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Frank Neese
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, Numéro 156, 2025, ISSN 0021-9606
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0088162

Novel Nanogels Loaded with Mn(II) Chelates as Effective and Biologically Stable MRI Probes

Auteurs: Fabio Carniato, Marco Ricci, Lorenzo Tei, Francesca Garello, Chiara Furlan, Enzo Terreno, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Mauro Botta
Publié dans: Small, Numéro 19, 2023, ISSN 1613-6810
Éditeur: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202302868

Phase distortion-free paramagnetic NMR spectra

Auteurs: Enrico Ravera
Publié dans: Journal of Magnetic Resonance Open, Numéro 8-9, 2023, Page(s) 100022, ISSN 2666-4410
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jmro.2021.100022

How does it really move? Recent progress in the investigation of protein nanosecond dynamics by NMR and simulation

Auteurs: Olof Stenström, Candide Champion, Marc Lehner, Guillaume Bouvignies, Sereina Riniker, Fabien Ferrage
Publié dans: Current Opinion in Structural Biology, Numéro 77, 2023, Page(s) 102459, ISSN 0959-440X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102459

Not only manganese, but fruit component effects dictate the efficiency of fruit juice as an oral magnetic resonance imaging contrast agent

Auteurs: G. Licciardi, D. Rizzo, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi, C. Luchinat
Publié dans: NMR in Biomedicine, Numéro 35-2, 2021, Page(s) e4623, ISSN 1099-1492
Éditeur: Wiley Analytical Science
DOI: 10.1002/nbm.4623

Extracting Trends From NMR Data With TrAGICo: A Python Toolbox

Auteurs: Letizia Fiorucci, Francesco Bruno, Leonardo Querci, Adam Kubrak, Jlenia Bindi, Nebojša Rodić, Giulia Licciardi, Enrico Luchinat, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Enrico Ravera
Publié dans: Magnetic Resonance in Chemistry, Numéro 63, 2025, Page(s) 628-654, ISSN 0749-1581
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5537

Combining Solid‐State NMR with Structural and Biophysical Techniques to Design Challenging Protein‐Drug Conjugates

Auteurs: Linda Cerofolini, Kristian Vasa, Elisa Bianconi, Maria Salobehaj, Giulia Cappelli, Alice Bonciani, Giulia Licciardi, Anna Pérez‐Ràfols, Luis Padilla‐Cortés, Sabrina Antonacci, Domenico Rizzo, Enrico Ravera, Caterina Viglianisi, Vito Calderone, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Antonio Macchiarulo, Stefano Menichetti, Marco Fragai
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 135, 2023, ISSN 0044-8249
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202303202

Field-dependent relaxation profiles of biomolecular systems

Auteurs: Adam Kubrak, Rajka Pejanovic, Kahinga Kamau, Danuta Kruk, Fabien Ferrage, Giacomo Parigi
Publié dans: Physical Chemistry Chemical Physics, Numéro 27, 2025, Page(s) 1756-1771, ISSN 1463-9076
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cp04306e

Large Protein Assemblies for High-Relaxivity Contrast Agents: The Case of Gadolinium-Labeled Asparaginase

Auteurs: G. Licciardi, D. Rizzo, M. Salobehaj, L. Massai, A. Geri, L. Messori, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi
Publié dans: Bioconjugate Chemistry, Numéro 33-12, 2022, Page(s) 2411–2419, ISSN 0020-1669
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00506

Iron Oxide Nanoparticles as Positive T1 Contrast Agents for Low-Field Magnetic Resonance Imaging at 64 mT

Auteurs: Samuel Oberdick, Kalina Jordanova, John Lundstrom, Giacomo Parigi, Megan Poorman, Gary Zabow, Kathryn Keenan
Publié dans: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2485292/v1

Sensitivity considerations on denoising series of spectra by singular value decomposition

Auteurs: Francesco Bruno, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera
Publié dans: Magnetic Resonance in Chemistry, Numéro 61, 2023, Page(s) 373-379, ISSN 0749-1581
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5338

Engineered Nonviral Protein Cages Modified for MR Imaging

Auteurs: M.A. Kaster, M.D. Levasseur, T.G.W. Edwardson, M.A. Caldwell, D. Hofmann, G. Licciardi, G. Parigi, C. Luchinat, D. Hilvert, T.J. Meade
Publié dans: ACS Applied Bio Materials, Numéro 6, 2023, Page(s) 591-602, ISSN 1520-5126
Éditeur: ACS
DOI: 10.1021/acsabm.2c00892

Revisiting paramagnetic relaxation enhancements in slowly rotating systems: how long is the long range?

Auteurs: Giovanni Bellomo, Enrico Ravera, Vito Calderone, Mauro Botta, Marco Fragai, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat
Publié dans: Magnetic Resonance, Numéro 2/1, 2021, Page(s) 25-31, ISSN 2699-0016
Éditeur: Copernicus
DOI: 10.5194/mr-2-25-2021

Explicit Models of Motion to Understand Protein Side-Chain Dynamics

Auteurs: N. Bolik-Coulon, O. Languin-Cattoën, D. Carnevale, M. Zachrdla, D. Laage, F. Sterpone, G. Stirnemann, F. Ferrage
Publié dans: Physical review letters, Numéro 129-20, 2022, Page(s) 203001, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.129.203001

High Relaxivity with No Coordinated Waters: A Seemingly Paradoxical Behavior of [Gd(DOTP)]5– Embedded in Nanogels

Auteurs: F. Carniato, M. Ricci, L. Tei, F. Garello, E. Terreno, E. Ravera, G. Parigi, C. Luchinat, M. Botta
Publié dans: Inorganic Chemistry, Numéro 61, 2022, Page(s) 5380–5387, ISSN 0020-1669
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.2c00225