Multiscale Dynamics with Ultrafast High-Resolution Relaxometry

Projektinformationen

HIRES-MULTIDYN

ID Finanzhilfevereinbarung: 899683

DOI

10.3030/899683

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 27 Mai 2020

Startdatum 1 Oktober 2020

Enddatum 30 September 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Gesamtkosten

€ 3 284 779,99

EU-Beitrag

€ 3 284 779,99

Koordiniert durch

ECOLE NORMALE SUPERIEURE
France

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Leistungen

Documents, reports (1)

Report on correReport on correlation functions for motions with and without geometric restrictions

Report developped on correlation functions for motions with or without geometric restrictions

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (20)

Paramagnetic Nuclear Magnetic Resonance: The Toolkit

Autoren: Leonardo Querci, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera, Mario Piccioli
Veröffentlicht in: Inorganics, Ausgabe 12, 2025, Seite(n) 15, ISSN 2304-6740
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/inorganics12010015

Detection of Metabolite–Protein Interactions in Complex Biological Samples by High-Resolution Relaxometry: Toward Interactomics by NMR

Autoren: Ziqing Wang, Simone Pisano, Veronica Ghini, Pavel Kadeřávek, Milan Zachrdla, Philippe Pelupessy, Morgan Kazmierczak, Thorsten Marquardsen, Jean-Max Tyburn, Guillaume Bouvignies, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Fabien Ferrage
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 143/25, 2021, Seite(n) 9393-9404, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c01388

A Quantum Chemistry View on Two Archetypical Paramagnetic Pentacoordinate Nickel(II) Complexes Offers a Fresh Look on Their NMR Spectra

Autoren: Enrico Ravera, Lucia Gigli, Barbara Czarniecki, Lucas Lang, Rainer Kümmerle, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Frank Neese, Claudio Luchinat
Veröffentlicht in: Inorganic Chemistry, Ausgabe 60/3, 2021, Seite(n) 2068-2075, ISSN 0020-1669
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.0c03635

Molecular motions in olive oil from nuclear magnetic relaxation over five orders of magnitude of magnetic field

Autoren: Giulia Licciardi, Letizia Fiorucci, Jorge A. Villanueva-Garibay, Olof Stenström, Enrico Ravera, Fabien Ferrage, Claudio Luchinat, Giacomo Parigi
Veröffentlicht in: Journal of Molecular Liquids, Ausgabe 437, 2025, Seite(n) 128538, ISSN 0167-7322
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.molliq.2025.128538

Deciphering the RNA recognition by Musashi-1 to design protein and RNA variants for <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i> applications

Autoren: Anna Pérez-Ràfols, Guillermo Pérez-Ropero, Linda Cerofolini, Luca Sperotto, Joel Roca-Martínez, R Anahí Higuera-Rodríguez, Pasquale Russomanno, Wolfgang Kaiser, Wim Vranken, U Helena Danielson, Alessandro Provenzani, Tommaso Martelli, Michael Sattler, Jos Buijs, Marco Fragai
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 53, 2025, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf741

Theoretical analysis of the long-distance limit of NMR chemical shieldings

Autoren: Lucas Lang, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Frank Neese
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, Ausgabe 156, 2025, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0088162

Novel Nanogels Loaded with Mn(II) Chelates as Effective and Biologically Stable MRI Probes

Autoren: Fabio Carniato, Marco Ricci, Lorenzo Tei, Francesca Garello, Chiara Furlan, Enzo Terreno, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Mauro Botta
Veröffentlicht in: Small, Ausgabe 19, 2023, ISSN 1613-6810
Herausgeber: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202302868

Phase distortion-free paramagnetic NMR spectra

Autoren: Enrico Ravera
Veröffentlicht in: Journal of Magnetic Resonance Open, Ausgabe 8-9, 2023, Seite(n) 100022, ISSN 2666-4410
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jmro.2021.100022

How does it really move? Recent progress in the investigation of protein nanosecond dynamics by NMR and simulation

Autoren: Olof Stenström, Candide Champion, Marc Lehner, Guillaume Bouvignies, Sereina Riniker, Fabien Ferrage
Veröffentlicht in: Current Opinion in Structural Biology, Ausgabe 77, 2023, Seite(n) 102459, ISSN 0959-440X
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102459

Not only manganese, but fruit component effects dictate the efficiency of fruit juice as an oral magnetic resonance imaging contrast agent

Autoren: G. Licciardi, D. Rizzo, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi, C. Luchinat
Veröffentlicht in: NMR in Biomedicine, Ausgabe 35-2, 2021, Seite(n) e4623, ISSN 1099-1492
Herausgeber: Wiley Analytical Science
DOI: 10.1002/nbm.4623

Extracting Trends From NMR Data With TrAGICo: A Python Toolbox

Autoren: Letizia Fiorucci, Francesco Bruno, Leonardo Querci, Adam Kubrak, Jlenia Bindi, Nebojša Rodić, Giulia Licciardi, Enrico Luchinat, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Enrico Ravera
Veröffentlicht in: Magnetic Resonance in Chemistry, Ausgabe 63, 2025, Seite(n) 628-654, ISSN 0749-1581
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5537

Combining Solid‐State NMR with Structural and Biophysical Techniques to Design Challenging Protein‐Drug Conjugates

Autoren: Linda Cerofolini, Kristian Vasa, Elisa Bianconi, Maria Salobehaj, Giulia Cappelli, Alice Bonciani, Giulia Licciardi, Anna Pérez‐Ràfols, Luis Padilla‐Cortés, Sabrina Antonacci, Domenico Rizzo, Enrico Ravera, Caterina Viglianisi, Vito Calderone, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Antonio Macchiarulo, Stefano Menichetti, Marco Fragai
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie, Ausgabe 135, 2023, ISSN 0044-8249
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202303202

Field-dependent relaxation profiles of biomolecular systems

Autoren: Adam Kubrak, Rajka Pejanovic, Kahinga Kamau, Danuta Kruk, Fabien Ferrage, Giacomo Parigi
Veröffentlicht in: Physical Chemistry Chemical Physics, Ausgabe 27, 2025, Seite(n) 1756-1771, ISSN 1463-9076
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cp04306e

Large Protein Assemblies for High-Relaxivity Contrast Agents: The Case of Gadolinium-Labeled Asparaginase

Autoren: G. Licciardi, D. Rizzo, M. Salobehaj, L. Massai, A. Geri, L. Messori, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi
Veröffentlicht in: Bioconjugate Chemistry, Ausgabe 33-12, 2022, Seite(n) 2411–2419, ISSN 0020-1669
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00506

Iron Oxide Nanoparticles as Positive T1 Contrast Agents for Low-Field Magnetic Resonance Imaging at 64 mT

Autoren: Samuel Oberdick, Kalina Jordanova, John Lundstrom, Giacomo Parigi, Megan Poorman, Gary Zabow, Kathryn Keenan
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2485292/v1

Sensitivity considerations on denoising series of spectra by singular value decomposition

Autoren: Francesco Bruno, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera
Veröffentlicht in: Magnetic Resonance in Chemistry, Ausgabe 61, 2023, Seite(n) 373-379, ISSN 0749-1581
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5338

Engineered Nonviral Protein Cages Modified for MR Imaging

Autoren: M.A. Kaster, M.D. Levasseur, T.G.W. Edwardson, M.A. Caldwell, D. Hofmann, G. Licciardi, G. Parigi, C. Luchinat, D. Hilvert, T.J. Meade
Veröffentlicht in: ACS Applied Bio Materials, Ausgabe 6, 2023, Seite(n) 591-602, ISSN 1520-5126
Herausgeber: ACS
DOI: 10.1021/acsabm.2c00892

Revisiting paramagnetic relaxation enhancements in slowly rotating systems: how long is the long range?

Autoren: Giovanni Bellomo, Enrico Ravera, Vito Calderone, Mauro Botta, Marco Fragai, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat
Veröffentlicht in: Magnetic Resonance, Ausgabe 2/1, 2021, Seite(n) 25-31, ISSN 2699-0016
Herausgeber: Copernicus
DOI: 10.5194/mr-2-25-2021

Explicit Models of Motion to Understand Protein Side-Chain Dynamics

Autoren: N. Bolik-Coulon, O. Languin-Cattoën, D. Carnevale, M. Zachrdla, D. Laage, F. Sterpone, G. Stirnemann, F. Ferrage
Veröffentlicht in: Physical review letters, Ausgabe 129-20, 2022, Seite(n) 203001, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.129.203001

High Relaxivity with No Coordinated Waters: A Seemingly Paradoxical Behavior of [Gd(DOTP)]5– Embedded in Nanogels

Autoren: F. Carniato, M. Ricci, L. Tei, F. Garello, E. Terreno, E. Ravera, G. Parigi, C. Luchinat, M. Botta
Veröffentlicht in: Inorganic Chemistry, Ausgabe 61, 2022, Seite(n) 5380–5387, ISSN 0020-1669
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.2c00225