Multiscale Dynamics with Ultrafast High-Resolution Relaxometry

Informazioni relative al progetto

HIRES-MULTIDYN

ID dell’accordo di sovvenzione: 899683

DOI

10.3030/899683

Progetto chiuso

Data della firma CE 27 Maggio 2020

Data di avvio 1 Ottobre 2020

Data di completamento 30 Settembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Costo totale

€ 3 284 779,99

Contributo UE

€ 3 284 779,99

Coordinato da

ECOLE NORMALE SUPERIEURE
France

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Documents, reports (1)

Report on correReport on correlation functions for motions with and without geometric restrictions

Report developped on correlation functions for motions with or without geometric restrictions

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (20)

Paramagnetic Nuclear Magnetic Resonance: The Toolkit

Autori: Leonardo Querci, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera, Mario Piccioli
Pubblicato in: Inorganics, Numero 12, 2025, Pagina/e 15, ISSN 2304-6740
Editore: MDPI AG
DOI: 10.3390/inorganics12010015

Detection of Metabolite–Protein Interactions in Complex Biological Samples by High-Resolution Relaxometry: Toward Interactomics by NMR

Autori: Ziqing Wang, Simone Pisano, Veronica Ghini, Pavel Kadeřávek, Milan Zachrdla, Philippe Pelupessy, Morgan Kazmierczak, Thorsten Marquardsen, Jean-Max Tyburn, Guillaume Bouvignies, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Fabien Ferrage
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 143/25, 2021, Pagina/e 9393-9404, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c01388

A Quantum Chemistry View on Two Archetypical Paramagnetic Pentacoordinate Nickel(II) Complexes Offers a Fresh Look on Their NMR Spectra

Autori: Enrico Ravera, Lucia Gigli, Barbara Czarniecki, Lucas Lang, Rainer Kümmerle, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Frank Neese, Claudio Luchinat
Pubblicato in: Inorganic Chemistry, Numero 60/3, 2021, Pagina/e 2068-2075, ISSN 0020-1669
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.0c03635

Molecular motions in olive oil from nuclear magnetic relaxation over five orders of magnitude of magnetic field

Autori: Giulia Licciardi, Letizia Fiorucci, Jorge A. Villanueva-Garibay, Olof Stenström, Enrico Ravera, Fabien Ferrage, Claudio Luchinat, Giacomo Parigi
Pubblicato in: Journal of Molecular Liquids, Numero 437, 2025, Pagina/e 128538, ISSN 0167-7322
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.molliq.2025.128538

Deciphering the RNA recognition by Musashi-1 to design protein and RNA variants for <i>in vitro</i> and <i>in vivo</i> applications

Autori: Anna Pérez-Ràfols, Guillermo Pérez-Ropero, Linda Cerofolini, Luca Sperotto, Joel Roca-Martínez, R Anahí Higuera-Rodríguez, Pasquale Russomanno, Wolfgang Kaiser, Wim Vranken, U Helena Danielson, Alessandro Provenzani, Tommaso Martelli, Michael Sattler, Jos Buijs, Marco Fragai
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 53, 2025, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf741

Theoretical analysis of the long-distance limit of NMR chemical shieldings

Autori: Lucas Lang, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Frank Neese
Pubblicato in: The Journal of Chemical Physics, Numero 156, 2025, ISSN 0021-9606
Editore: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0088162

Novel Nanogels Loaded with Mn(II) Chelates as Effective and Biologically Stable MRI Probes

Autori: Fabio Carniato, Marco Ricci, Lorenzo Tei, Francesca Garello, Chiara Furlan, Enzo Terreno, Enrico Ravera, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Mauro Botta
Pubblicato in: Small, Numero 19, 2023, ISSN 1613-6810
Editore: Wiley - V C H Verlag GmbbH & Co.
DOI: 10.1002/smll.202302868

Phase distortion-free paramagnetic NMR spectra

Autori: Enrico Ravera
Pubblicato in: Journal of Magnetic Resonance Open, Numero 8-9, 2023, Pagina/e 100022, ISSN 2666-4410
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jmro.2021.100022

How does it really move? Recent progress in the investigation of protein nanosecond dynamics by NMR and simulation

Autori: Olof Stenström, Candide Champion, Marc Lehner, Guillaume Bouvignies, Sereina Riniker, Fabien Ferrage
Pubblicato in: Current Opinion in Structural Biology, Numero 77, 2023, Pagina/e 102459, ISSN 0959-440X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102459

Not only manganese, but fruit component effects dictate the efficiency of fruit juice as an oral magnetic resonance imaging contrast agent

Autori: G. Licciardi, D. Rizzo, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi, C. Luchinat
Pubblicato in: NMR in Biomedicine, Numero 35-2, 2021, Pagina/e e4623, ISSN 1099-1492
Editore: Wiley Analytical Science
DOI: 10.1002/nbm.4623

Extracting Trends From NMR Data With TrAGICo: A Python Toolbox

Autori: Letizia Fiorucci, Francesco Bruno, Leonardo Querci, Adam Kubrak, Jlenia Bindi, Nebojša Rodić, Giulia Licciardi, Enrico Luchinat, Giacomo Parigi, Mario Piccioli, Enrico Ravera
Pubblicato in: Magnetic Resonance in Chemistry, Numero 63, 2025, Pagina/e 628-654, ISSN 0749-1581
Editore: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5537

Combining Solid‐State NMR with Structural and Biophysical Techniques to Design Challenging Protein‐Drug Conjugates

Autori: Linda Cerofolini, Kristian Vasa, Elisa Bianconi, Maria Salobehaj, Giulia Cappelli, Alice Bonciani, Giulia Licciardi, Anna Pérez‐Ràfols, Luis Padilla‐Cortés, Sabrina Antonacci, Domenico Rizzo, Enrico Ravera, Caterina Viglianisi, Vito Calderone, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Antonio Macchiarulo, Stefano Menichetti, Marco Fragai
Pubblicato in: Angewandte Chemie, Numero 135, 2023, ISSN 0044-8249
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202303202

Field-dependent relaxation profiles of biomolecular systems

Autori: Adam Kubrak, Rajka Pejanovic, Kahinga Kamau, Danuta Kruk, Fabien Ferrage, Giacomo Parigi
Pubblicato in: Physical Chemistry Chemical Physics, Numero 27, 2025, Pagina/e 1756-1771, ISSN 1463-9076
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cp04306e

Large Protein Assemblies for High-Relaxivity Contrast Agents: The Case of Gadolinium-Labeled Asparaginase

Autori: G. Licciardi, D. Rizzo, M. Salobehaj, L. Massai, A. Geri, L. Messori, E. Ravera, M. Fragai, G. Parigi
Pubblicato in: Bioconjugate Chemistry, Numero 33-12, 2022, Pagina/e 2411–2419, ISSN 0020-1669
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00506

Iron Oxide Nanoparticles as Positive T1 Contrast Agents for Low-Field Magnetic Resonance Imaging at 64 mT

Autori: Samuel Oberdick, Kalina Jordanova, John Lundstrom, Giacomo Parigi, Megan Poorman, Gary Zabow, Kathryn Keenan
Pubblicato in: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2485292/v1

Sensitivity considerations on denoising series of spectra by singular value decomposition

Autori: Francesco Bruno, Letizia Fiorucci, Enrico Ravera
Pubblicato in: Magnetic Resonance in Chemistry, Numero 61, 2023, Pagina/e 373-379, ISSN 0749-1581
Editore: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/mrc.5338

Engineered Nonviral Protein Cages Modified for MR Imaging

Autori: M.A. Kaster, M.D. Levasseur, T.G.W. Edwardson, M.A. Caldwell, D. Hofmann, G. Licciardi, G. Parigi, C. Luchinat, D. Hilvert, T.J. Meade
Pubblicato in: ACS Applied Bio Materials, Numero 6, 2023, Pagina/e 591-602, ISSN 1520-5126
Editore: ACS
DOI: 10.1021/acsabm.2c00892

Revisiting paramagnetic relaxation enhancements in slowly rotating systems: how long is the long range?

Autori: Giovanni Bellomo, Enrico Ravera, Vito Calderone, Mauro Botta, Marco Fragai, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat
Pubblicato in: Magnetic Resonance, Numero 2/1, 2021, Pagina/e 25-31, ISSN 2699-0016
Editore: Copernicus
DOI: 10.5194/mr-2-25-2021

Explicit Models of Motion to Understand Protein Side-Chain Dynamics

Autori: N. Bolik-Coulon, O. Languin-Cattoën, D. Carnevale, M. Zachrdla, D. Laage, F. Sterpone, G. Stirnemann, F. Ferrage
Pubblicato in: Physical review letters, Numero 129-20, 2022, Pagina/e 203001, ISSN 0031-9007
Editore: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.129.203001

High Relaxivity with No Coordinated Waters: A Seemingly Paradoxical Behavior of [Gd(DOTP)]5– Embedded in Nanogels

Autori: F. Carniato, M. Ricci, L. Tei, F. Garello, E. Terreno, E. Ravera, G. Parigi, C. Luchinat, M. Botta
Pubblicato in: Inorganic Chemistry, Numero 61, 2022, Pagina/e 5380–5387, ISSN 0020-1669
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.2c00225