Objetivo
The immune system can patrol cell status by recognising epitopes bound to Human Leukocyte Antigen class I (HLA-I) molecules and triggering cytotoxic T cell (CTL) activation. Epitopes arrive at the cell surface through several steps of the antigen processing and presentation pathway (APP). Despite major discoveries in the past decades, the precise dynamics of APP are still not fully understood. These dynamics, however, determine the types and quantities of epitopes and therefore regulate the CTL response.
The objective of my project is the development of an APP model from gene transcription to recognition by CTL clones that captures the underlying APP mechanisms and dynamics. Current approaches are mainly machine learning-based and focus only on parts of the APP. They neglect the underlying APP dynamics and do not elucidate novel mechanisms. Therefore, they fail to predict epitopes under altered cellular states such as infection. My project overcomes this pitfall by complementing large scale machine learning approaches with mechanistic modelling to comprehensively understand the APP and enable successful epitope prediction.
To achieve this goal, I will:
1) develop an APP integrated computational description that combines a mechanistic model of the APP (based on detailed quantitative in vitro data) with a large-scale machine learning-based multi-omics model;
2) apply the model in two therapeutic-relevant cellular systems – Measles virus infection and chemotherapy-induced senescence – resulting in the educated identification of canonical and non-canonical epitopes.
This project is at the cutting edge of the research with direct application in epitope discovery for therapies such as anti-cancer immunotherapy, vaccination against infection and modulatory immunotherapies against autoimmune diseases. The implemented computational framework will be made available to the community thereby providing a direct benefit to European scientific public and private sectors.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias médicas y de la salud medicina básica inmunología inmunoterapia
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-STG - Starting Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2020-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
80539 MUNCHEN
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.