Objectif
The immune system can patrol cell status by recognising epitopes bound to Human Leukocyte Antigen class I (HLA-I) molecules and triggering cytotoxic T cell (CTL) activation. Epitopes arrive at the cell surface through several steps of the antigen processing and presentation pathway (APP). Despite major discoveries in the past decades, the precise dynamics of APP are still not fully understood. These dynamics, however, determine the types and quantities of epitopes and therefore regulate the CTL response.
The objective of my project is the development of an APP model from gene transcription to recognition by CTL clones that captures the underlying APP mechanisms and dynamics. Current approaches are mainly machine learning-based and focus only on parts of the APP. They neglect the underlying APP dynamics and do not elucidate novel mechanisms. Therefore, they fail to predict epitopes under altered cellular states such as infection. My project overcomes this pitfall by complementing large scale machine learning approaches with mechanistic modelling to comprehensively understand the APP and enable successful epitope prediction.
To achieve this goal, I will:
1) develop an APP integrated computational description that combines a mechanistic model of the APP (based on detailed quantitative in vitro data) with a large-scale machine learning-based multi-omics model;
2) apply the model in two therapeutic-relevant cellular systems – Measles virus infection and chemotherapy-induced senescence – resulting in the educated identification of canonical and non-canonical epitopes.
This project is at the cutting edge of the research with direct application in epitope discovery for therapies such as anti-cancer immunotherapy, vaccination against infection and modulatory immunotherapies against autoimmune diseases. The implemented computational framework will be made available to the community thereby providing a direct benefit to European scientific public and private sectors.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie immunothérapie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
80539 MUNCHEN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.