Skip to main content
Aller à la page d’accueil de la Commission européenne (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)
français français
CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS
CORDIS Web 30th anniversary CORDIS Web 30th anniversary

Cracking the Code for Protein Quality Control Mechanisms Recognizing Exposed Hydrophobicity in Protein Substrates

Description du projet

Des mécanismes cellulaires permettant de maintenir un protéome sain

La protéostase est un mécanisme qui aide les cellules à maintenir un protéome sain. La perte de cette fonction a été associée au vieillissement et aux maladies. Les cellules préservent la protéostase en utilisant des voies de contrôle de la qualité des protéines (CQP) qui surveillent le devenir d’une protéine, de sa synthèse à sa dégradation. Les résidus hydrophobes exposés dans les protéines aberrantes ou mal localisées sont les signaux reconnus par les différents mécanismes de CQP. L’objectif du projet HyDegronomics, financé par l’UE, est de réaliser une étude complète de l’hydrophobie exposée et du champ de CQP. Un large éventail de méthodes seront utilisées dans cette étude pour comprendre la signification physiologique des mécanismes de CQP et la manière dont les caractéristiques aberrantes des protéines sont reconnues, générant ainsi des connaissances sur le développement de nouvelles stratégies d’intervention thérapeutique qui ciblent les protéines anormales impliquées dans les maladies.

Objectif

Proteostasis is a highly regulated process by which cells maintain a healthy proteome. Loss of proteostasis is a common feature of aging and disease. To preserve proteostasis, the cell has developed protein quality control (PQC) pathways that monitor a proteins’s fate from synthesis to degradation. Exposed hydrophobic residues in aberrant or mislocalized protein substrates is a key feature recognized by distinct PQC mechanisms. If not handled properly, exposed hydrophobicity can result in protein aggregation and subsequent reduced cell fitness. To prevent accumulation of toxic aggregates, cells are equipped both with chaperones and proteolytic pathways. Within the degradation systems, E3 ligases are the major determinants of specificity, which is achieved through their selective recognition of specific short peptide motifs, or degrons, in substrate proteins. Despite the growing list of PQC players and substrates, it has yet to be determined what are the client range, selectivity and specificity of each of the PQC mechanisms. The objective of this proposal is to systematically investigate the exposed hydrophobicity “code” and to advance the state-of-the-art of the PQC field. Here, we utilize the GPS-peptidome method that we recently developed together with genetics, biochemistry, cell biology and proteomic approaches to: (1) map distinct classes of hydrophobic degrons to elucidate the specificity of substrate selection; (2) identify novel E3 ligases playing a role in PQC pathways, explore redundancies among them and identify endogenous substrates proteome- wide; (3) investigate the physiological significance of PQC mechanisms. This work will provide a comprehensive view of PQC pathways that recognize hydrophobicity. This is critical to further our understanding on how aberrant features in proteins are recognized and can provide valuable information for the development of new therapeutic intervention strategies that target abnormal proteins implicated in disease.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction

Régime de financement

ERC-STG - Starting Grant

Institution d’accueil

BAR ILAN UNIVERSITY
Contribution nette de l'UE
€ 1 801 490,00

Bénéficiaires (1)