Opis projektu
Komórkowe mechanizmy utrzymania zdrowego proteomu
Proteostaza to mechanizm, który pomaga komórkom utrzymać proteom w zdrowej kondycji, a utrata tej funkcji jest związana ze starzeniem się i chorobami. Komórki utrzymują proteostazę za pomocą szlaków kontroli jakości białek (PQC), które monitorują losy białka od syntezy do degradacji. Wyeksponowane resztki hydrofobowe w nieprawidłowo zlokalizowanych białkach są sygnałami rozpoznawanymi przez różne mechanizmy PQC. Celem finansowanego przez UE projektu HyDegronomics jest przeprowadzenie kompleksowych badań nad wyeksponowaną hydrofobowością i polem PQC. W badaniach zostanie wykorzystane szerokie spektrum metod mających pozwolić na zrozumienie fizjologicznego znaczenia mechanizmów PQC oraz sposobu rozpoznawania nieprawidłowych cech białek, co pozwoli na uzyskanie wiedzy umożliwiającej opracowanie nowych strategii interwencji terapeutycznych, ukierunkowanych na nieprawidłowe białka, które mają wpływ na rozwój chorób.
Cel
Proteostasis is a highly regulated process by which cells maintain a healthy proteome. Loss of proteostasis is a common feature of aging and disease. To preserve proteostasis, the cell has developed protein quality control (PQC) pathways that monitor a proteins’s fate from synthesis to degradation. Exposed hydrophobic residues in aberrant or mislocalized protein substrates is a key feature recognized by distinct PQC mechanisms. If not handled properly, exposed hydrophobicity can result in protein aggregation and subsequent reduced cell fitness. To prevent accumulation of toxic aggregates, cells are equipped both with chaperones and proteolytic pathways. Within the degradation systems, E3 ligases are the major determinants of specificity, which is achieved through their selective recognition of specific short peptide motifs, or degrons, in substrate proteins. Despite the growing list of PQC players and substrates, it has yet to be determined what are the client range, selectivity and specificity of each of the PQC mechanisms. The objective of this proposal is to systematically investigate the exposed hydrophobicity “code” and to advance the state-of-the-art of the PQC field. Here, we utilize the GPS-peptidome method that we recently developed together with genetics, biochemistry, cell biology and proteomic approaches to: (1) map distinct classes of hydrophobic degrons to elucidate the specificity of substrate selection; (2) identify novel E3 ligases playing a role in PQC pathways, explore redundancies among them and identify endogenous substrates proteome- wide; (3) investigate the physiological significance of PQC mechanisms. This work will provide a comprehensive view of PQC pathways that recognize hydrophobicity. This is critical to further our understanding on how aberrant features in proteins are recognized and can provide valuable information for the development of new therapeutic intervention strategies that target abnormal proteins implicated in disease.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznegenetyka
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałkaproteomika
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
ERC-STG - Starting GrantInstytucja przyjmująca
52900 Ramat Gan
Izrael