Descrizione del progetto
Rivelare i determinanti molecolari della sintesi proteica in vivo
Un targeting, un ripiegamento e una sintesi corretti delle proteine sono fondamentali per tutte le cellule viventi. Vista la crescente domanda di proteine terapeutiche quali gli anticorpi, è urgente capire e controllare i meccanismi molecolari responsabili di questo processo. Il progetto SMACK, finanziato dall’UE, cercherà di capire in che modo la sequenza dell’mRNA determini in definitiva come, dove e quando un polipeptide si ripiega. Usando un sistema sperimentale e analitico basato sulla fluorescenza, gli scienziati analizzeranno la cinetica della sintesi proteica a livello della singola molecola direttamente all’interno della cellula vivente, nonché il modo in cui gli antibiotici clinicamente rilevanti inibiscono questo processo. La conoscenza acquisita fornirà indizi sulla struttura dei sistemi produttivi della proteina a base microbica, nonché sulla progettazione di nuovi antibiotici.
Obiettivo
This project aims to map the determinants of efficient synthesis, folding, and targeting of proteins in living bacterial cells, and to understand how antibiotic drugs inhibit these events. Our findings will be used to form a quantitative description of how the mRNA sequence ultimately determines how, where, and when a polypeptide should fold, which will help to design better E. coli-based production systems for recombinant proteins; both protein folding and targeting are currently severe bottlenecks. Further, by studying the effect of clinically relevant antibiotic drugs directly on ongoing protein synthesis, we will learn how the inhibitory action on the molecular level is translated into the response on cell and population level. This knowledge will help to improve the use of current drugs, as well as to provide clues regarding how new drugs should be designed.
To reach our goals, we will use and further develop our recently published fluorescence-based experimental and analytical system for live-cell single-molecule analysis of protein synthesis kinetics. Particularly, we will develop orthogonal translation systems to measure protein synthesis kinetics on defined mRNAs in an unperturbed cell background. We will also label and study key components of the universal pathway for Signal Recognition Particle-mediated cotranslational targeting of peptides to the membrane-bound peptide translocation complexes. In these applications we use small organic dyes for site-specific labeling of molecules, which allow recording of long diffusion trajectories inside cells. These trajectories are then fed to our machine-learning algorithms to deduce the binding kinetics.
With an increasing demand for therapeutic proteins, such as monoclonal antibodies for cancer treatment, there is an urgent need for microbial-based systems for cost-effective production of recombinant proteins. With our unique experimental and analytical system, we have the opportunity to aid in this development.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine ripiegamento proteico
- scienze mediche e della salute medicina di base farmacologia e farmacia farmaci antibiotici
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale apprendimento automatico
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-STG - Starting Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2020-STG
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bandoIstituzione ospitante
Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
751 05 Uppsala
Svezia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.