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Cross-omics integration to identify modulators for improving vaccine efficacy

Description du projet

Prédire la variation de la réponse à la vaccination contre la grippe

L’efficacité de la vaccination contre la grippe varie considérablement d’un individu à l’autre, mais l’étiologie sous‑jacente reste mal comprise. Le projet ModVaccine, financé par l’UE, a pour but de faire la lumière sur les déterminants génétiques, environnementaux et de l’hôte de la réponse à la vaccination. Les scientifiques étudieront des personnes vaccinées et intégreront des ensembles de données omiques aux phénotypes immunitaires. Les types de cellules, les molécules et les voies identifiées qui interviennent dans les réponses immunitaires induites par la vaccination seront intégrés dans des modèles mathématiques capables de prédire les variations individuelles de la réponse à la vaccination. Le modèle de prédiction ModVaccine est susceptible d’améliorer la conception future des vaccins contre la grippe.

Objectif

Influenza is a significant public health threat and vaccines are crucial for preventing infections at population-level. The efficacy of vaccination per individual, however, is highly variable. The causes for this broad variability in vaccine response between individuals remain poorly understood. In this proposal, I hypothesize that genetic variants and their downstream pathways underlie the heterogeneity in vaccine response between individuals. This ERC project aims to for the first time, systematically investigate the interactions between genetic, non-genetic host and environmental factors, and the response to vaccination in order to build reliable models for predicting vaccine efficacy. The outcomes of this research will pinpoint key deterministic factors and identify modulators that can be used to improve vaccination strategies. This project is based on the expertise that my research group has built up for identifying the downstream consequences of genetic variants, and for predictive modelling through integration of large cross-omics datasets. Given the rapid evolution of influenza virus, I will use seasonal trivalent inactivated influenza vaccines as prototype responses within two cohorts of 500 individuals from the Netherlands and 200 individuals from Germany. I will systematically generate, analyse, and integrate the cross-omics data (six layers of information from genome, epigenome, transcriptome, proteome, metabolome, and microbiome) with immune phenotypes (e.g. antibody titers, an important indicator of protection) using novel computational methods. This research will reveal the previously unknown cell-types, molecules, and pathways involved in vaccine-induced immune response and provide mathematical models for predicting individual variation in immune response, a crucial first step towards personalized prevention. The key molecules I identify will provide leads for pharmacological modulators for improving vaccine efficacy.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Régime de financement

ERC-STG - Starting Grant

Institution d’accueil

HELMHOLTZ-ZENTRUM FUR INFEKTIONSFORSCHUNG GMBH
Contribution nette de l'UE
€ 1 499 871,00
Adresse
INHOFFENSTRASSE 7
38124 Braunschweig
Allemagne

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Région
Niedersachsen Braunschweig Braunschweig, Kreisfreie Stadt
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
€ 1 499 871,00

Bénéficiaires (1)