Descripción del proyecto
Análisis del mecanismo de exportación del ARNm en el núcleo
El transporte dentro y fuera del núcleo constituye un proceso muy selectivo llevado a cabo por un conjunto específico de proteínas. En lo que respecta al ARNm, este debe someterse a un tratamiento y una maduración completos en el núcleo antes de atravesar la membrana nuclear. El proyecto RNApaxport, financiado con fondos europeos, tiene como objetivo arrojar luz sobre el mecanismo de esta especificidad del transporte del ARNm. En concreto, los científicos investigarán cómo un conjunto definido de proteínas conservadas puede empaquetar y exportar todo el ARNm nuclear. Para ello, examinarán la organización, la dinámica y la función de los principales factores de empaquetamiento. La información sobre el papel de la longitud y la secuencia del ARNm permitirá comprender los mecanismos complejos de la expresión de genes.
Objetivo
Eukaryotic gene expression is partitioned across two cellular compartments: the nucleus, where messenger RNA (mRNA) is produced, and the cytoplasm, where protein translation occurs. mRNA export across the nuclear membrane is highly selective, ensuring that only fully processed and mature mRNA is transported to the cytoplasm. Yet how does the multi-step mRNA maturation process converge to a binary decision, ‘to export or not to export’? While we know many of the proteins involved in packaging and export of nuclear mRNA ribonucleoprotein complexes (mRNPs), how a defined set of conserved proteins package and export all nuclear mRNA remains poorly understood. To reveal how specificity towards mature mRNA is achieved and to identify regulatory checkpoints, I propose to visualize key mRNP intermediates using a state-of-the-art integrative structural biology approach. First, we will determine the human THO/TREX complex structure to reveal how this key packaging factor is organized and brought to mRNA (aim 1). Second, we will determine the structure of a human mRNP 5’-end to explain how two key features of mature mRNPs, the 5’-cap and the first splice junction, are recognized and integrated by THO/TREX to achieve export competence (aim 2). Third, we will obtain the architecture of endogenous human mRNPs to reveal their dynamics and to determine how mRNAs of varied length and sequence are packaged (aim 3). These data will enable the complementary and targeted in vitro and in vivo structure-function analysis. Taken together, the expected results will reveal novel insights into the mechanisms that underlie an important step of gene expression, which mediates nuclear mRNA quality control and links transcription to translation. My background in structural biology, mRNA transcription and processing is ideally suited to carry out this high-impact proposal.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-STG - Starting GrantInstitución de acogida
1030 Wien
Austria