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Mechanisms of human mRNA packaging and export

Descrizione del progetto

Esaminare il meccanismo dell’esportazione di mRNA dal nucleo

Il trasporto da e verso il nucleo è un processo estremamente selettivo svolto da un insieme specifico di proteine. In termini di mRNA, la sua elaborazione e la sua maturazione deve essere completata nel nucleo prima di attraversare il suo rivestimento. Il progetto RNApaxport, finanziato dall’UE, si propone di chiarire il meccanismo di questa specificità del trasporto di mRNA. In particolare, gli scienziati analizzeranno il modo in cui un insieme definito di proteine conservate confeziona ed esporta tutto l’mRNA del nucleo. A tal fine, esamineranno l’organizzazione, le dinamiche e la funzione dei complessi fattori di preparazione al trasporto. Le informazioni sul ruolo della lunghezza e della sequenza di mRNA aiuteranno a comprendere i complessi meccanismi dell’espressione genica.

Obiettivo

Eukaryotic gene expression is partitioned across two cellular compartments: the nucleus, where messenger RNA (mRNA) is produced, and the cytoplasm, where protein translation occurs. mRNA export across the nuclear membrane is highly selective, ensuring that only fully processed and mature mRNA is transported to the cytoplasm. Yet how does the multi-step mRNA maturation process converge to a binary decision, ‘to export or not to export’? While we know many of the proteins involved in packaging and export of nuclear mRNA ribonucleoprotein complexes (mRNPs), how a defined set of conserved proteins package and export all nuclear mRNA remains poorly understood. To reveal how specificity towards mature mRNA is achieved and to identify regulatory checkpoints, I propose to visualize key mRNP intermediates using a state-of-the-art integrative structural biology approach. First, we will determine the human THO/TREX complex structure to reveal how this key packaging factor is organized and brought to mRNA (aim 1). Second, we will determine the structure of a human mRNP 5’-end to explain how two key features of mature mRNPs, the 5’-cap and the first splice junction, are recognized and integrated by THO/TREX to achieve export competence (aim 2). Third, we will obtain the architecture of endogenous human mRNPs to reveal their dynamics and to determine how mRNAs of varied length and sequence are packaged (aim 3). These data will enable the complementary and targeted in vitro and in vivo structure-function analysis. Taken together, the expected results will reveal novel insights into the mechanisms that underlie an important step of gene expression, which mediates nuclear mRNA quality control and links transcription to translation. My background in structural biology, mRNA transcription and processing is ideally suited to carry out this high-impact proposal.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-STG - Starting Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2020-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

FORSCHUNGSINSTITUT FUR MOLEKULARE PATHOLOGIE GESELLSCHAFT MBH
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 500 000,00
Indirizzo
CAMPUS-VIENNA-BIOCENTER 1
1030 Wien
Austria

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Regione
Ostösterreich Wien Wien
Tipo di attività
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 500 000,00

Beneficiari (1)

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