Descrizione del progetto
L’evoluzione del meccanismo epigenetico della metilazione del DNA
La metilazione della citosina del DNA è una forma importante di modificazione del DNA nel genoma che ha un ruolo fondamentale nella struttura della cromatina e nell’espressione genica. La metilazione degli elementi trasponibili silenti e dei geni trascritti costitutivamente è il processo di metilazione del DNA che è stato studiato in maniera più approfondita nei vertebrati, nelle piante e nei funghi. I geni di metilazione non sono sempre ortologhi in linee divergenti e potrebbero essere i prodotti di un’evoluzione convergente. Il progetto METHYLEVOL, finanziato dall’UE, studierà l’evoluzione della metilazione del DNA, determinando il suo ruolo nella diversità eucariotica. Utilizzando tecniche genomiche all’avanguardia, manipolazioni sperimentali e analisi computazionali, la ricerca stabilirà un collegamento tra l’epigenomica sperimentale e la genomica comparativa macroevolutiva, rivelando in che modo le funzioni della metilazione del DNA si sono distribuite nel corso dell’evoluzione.
Obiettivo
Cytosine DNA methylation is a major component of eukaryotic chromatin, yet extensive variation of methylation patterns occurs throughout eukaryotes. So far, the roles of DNA methylation have been mostly characterized in vertebrates, plants and fungi, where two common patterns have emerged as potentially ancestral within eukaryotes: methylation of silent transposable elements and methylation of constitutively transcribed genes (gene body methylation). However, the genes responsible for depositing methylation are not always orthologous across divergent lineages, so these common patterns could instead be the product of convergent evolution. To discern between these alternatives, we first need to correct the taxon sampling bias that hampers our understanding about the evolution of DNA methylation.
In this project we will determine the roles of DNA methylation across vastly underexplored eukaryotic diversity. We will use state-of-the-art genomic techniques, experimental manipulations and computational analyses to trace the evolutionary conservation of methylation-dependent transposable element silencing across a wide range of unicellular eukaryotes, using methylation-depleting drugs and bisulfite sequencing. We will then assess the roles of gene body methylation in an invertebrate to unveil similarities with plants and shed light on why vertebrates transitioned to hypermethylated genomes. Finally, we will study the evolution of proteins able to bind and interpret DNA methylation across disparate eukaryotes, since ultimately these proteins link DNA methylation and its regulatory functions.
Through linking experimental epigenomics to macro-evolutionary comparative genomics this project will reveal how different functions of DNA methylation assembled throughout evolution. In turn, this evolutionary perspective will allow a better understanding of the genome regulatory roles of this base modification and its impact on genome composition in plants and animals.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica epigenetica
- scienze naturali scienze biologiche zoologia zoologia degli invertebrati
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-STG - Starting Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2020-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
E1 4NS LONDON
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.