Descrizione del progetto
Formare bioinformatici altamente specializzati nella proteomica
La spettrometria di massa è utilizzata per la quantificazione di materiali noti e l’individuazione di composti sconosciuti ed è abbastanza potente da svelare la struttura e le proprietà chimiche di molecole differenti. Si tratta di una delle tecnologie principali impiegate nell’ambito della proteomica, ovvero lo studio delle proteine espresse nella cellula, nell’organismo o nel tessuto. La spettrometria di massa è in rapida evoluzione grazie all’acquisizione di metodi e di strutture di dati ad alto contenuto che ne ampliano le applicazioni tecnologiche, molte delle quali si basano sull’intelligenza artificiale. Tutte queste possibilità sperimentali richiedono l’elaborazione di nuovi algoritmi nonché di strumenti interattivi e altamente visivi. Pertanto, occorre un numero maggiore di bioinformatici provvisti di una formazione adeguata. Il progetto PROTrEIN, finanziato dall’UE, sta facendo convergere il mondo accademico e il settore non accademico tramite la formazione di una nuova generazione di bioinformatici specializzati per iniziare a trattare la proteomica computazionale.
Obiettivo
PROTrEIN is a Training Network composed of 12 beneficiaries, and 8 partner organizations, from the academic and non-academic sectors with the mission to train a new generation of specialized bioinformaticians and improve their future employability while tackling the main challenges in computational proteomics. Mass spectrometry (MS) is one of the most powerful technologies for the study of the cellular proteome, and it is present in many translational research projects for the diagnosis and prognosis of multiple diseases, and for elucidating the mechanisms of action of drugs of medical interest. While several proteomics workflows are well established, the field is fast evolving with new acquisition methods and high-content data structures that expand the applications of the technology and make it one of the principal platforms in the multi-omics universe. Many of these developments require the assistance of artificial intelligence for the acquisition of next generation proteomics datasets, as well as the development of new processing algorithms to reveal hidden proteoforms, interactions, and protein modifications. Moreover, the usage of the new experimental possibilities requires the development of interactive and highly-visual tools for the integration and presentation of proteomics data with other omics datasets. Although addressing these different needs is crucial to deliver major contributions in our understanding of biological processes, the shortage of sufficiently trained bioinformaticians represents a major limitation. Therefore, PROTrEIN puts together an ambitious scientific and training programme to tackle both the challenges in proteomics research and the training of highly valuated professionals by mastering them on: a) the MS raw data structure and information content, b) MS acquisition methods, c) algorithms, gamification, and machine learning tools, d) data integration and visualization, e) science communication, f) data management, and g) RRI.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
- scienze naturaliscienze biologichebiochimicabiomolecoleproteineproteomica
- scienze naturaliscienze chimichechimica analiticaspettrometria di massa
- scienze naturaliinformatica e scienze dell'informazioneintelligenza artificialeapprendimento automatico
È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione
Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-ITN - Marie Skłodowska-Curie Innovative Training Networks (ITN)Coordinatore
08003 Barcelona
Spagna