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Computational Proteomics Training European Innovative Network

Descrizione del progetto

Formare bioinformatici altamente specializzati nella proteomica

La spettrometria di massa è utilizzata per la quantificazione di materiali noti e l’individuazione di composti sconosciuti ed è abbastanza potente da svelare la struttura e le proprietà chimiche di molecole differenti. Si tratta di una delle tecnologie principali impiegate nell’ambito della proteomica, ovvero lo studio delle proteine espresse nella cellula, nell’organismo o nel tessuto. La spettrometria di massa è in rapida evoluzione grazie all’acquisizione di metodi e di strutture di dati ad alto contenuto che ne ampliano le applicazioni tecnologiche, molte delle quali si basano sull’intelligenza artificiale. Tutte queste possibilità sperimentali richiedono l’elaborazione di nuovi algoritmi nonché di strumenti interattivi e altamente visivi. Pertanto, occorre un numero maggiore di bioinformatici provvisti di una formazione adeguata. Il progetto PROTrEIN, finanziato dall’UE, sta facendo convergere il mondo accademico e il settore non accademico tramite la formazione di una nuova generazione di bioinformatici specializzati per iniziare a trattare la proteomica computazionale.

Obiettivo

PROTrEIN is a Training Network composed of 12 beneficiaries, and 8 partner organizations, from the academic and non-academic sectors with the mission to train a new generation of specialized bioinformaticians and improve their future employability while tackling the main challenges in computational proteomics. Mass spectrometry (MS) is one of the most powerful technologies for the study of the cellular proteome, and it is present in many translational research projects for the diagnosis and prognosis of multiple diseases, and for elucidating the mechanisms of action of drugs of medical interest. While several proteomics workflows are well established, the field is fast evolving with new acquisition methods and high-content data structures that expand the applications of the technology and make it one of the principal platforms in the multi-omics universe. Many of these developments require the assistance of artificial intelligence for the acquisition of next generation proteomics datasets, as well as the development of new processing algorithms to reveal hidden proteoforms, interactions, and protein modifications. Moreover, the usage of the new experimental possibilities requires the development of interactive and highly-visual tools for the integration and presentation of proteomics data with other omics datasets. Although addressing these different needs is crucial to deliver major contributions in our understanding of biological processes, the shortage of sufficiently trained bioinformaticians represents a major limitation. Therefore, PROTrEIN puts together an ambitious scientific and training programme to tackle both the challenges in proteomics research and the training of highly valuated professionals by mastering them on: a) the MS raw data structure and information content, b) MS acquisition methods, c) algorithms, gamification, and machine learning tools, d) data integration and visualization, e) science communication, f) data management, and g) RRI.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-ITN - Marie Skłodowska-Curie Innovative Training Networks (ITN)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-ITN-2020

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 376 357,32
Indirizzo
CARRER DOCTOR AIGUADER 88
08003 Barcelona
Spagna

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Regione
Este Cataluña Barcelona
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 376 357,32

Partecipanti (11)

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