Description du projet
Une importante technique de caractérisation des protéines permet de surveiller le processus en temps réel
Les protéines sont l’un des polymères les plus importants de la nature, omniprésent dans les organismes vivants. Leurs fonctions critiques sont étroitement liées à leurs structures 3D. La caractérisation de ces structures 3D est donc fondamentale pour de nombreuses applications en biomédecine, mais aussi pour la détection environnementale, le traitement des eaux usées et, de plus en plus, pour des solutions naturelles dans des domaines qui vont de l’énergie à l’électronique organique. La cristallographie des protéines par rayons X est une technique importante utilisée pour déterminer la position 3D de chaque atome dans une protéine à partir d’une haute concentration de la protéine purifiée qui est ensuite cristallisée. La première étape, et peut-être la plus difficile, consiste à obtenir des cristaux de la protéine en question. En règle générale, il conviendra d’essayer de nombreuses conditions de cristallisation. Le projet Fail Fast, financé par l’UE, développe une méthodologie pour caractériser la formation de nanocristaux avant que les cristaux n’aient grandi, mettant ainsi fin aux tâtonnements avec à la clé des avantages significatifs en termes de temps, d’argent et de résultats.
Objectif
High-resolution protein structures obtained by X-ray diffraction require the production of well-ordered proteins crystals of high quality. However, to produce well-ordered protein crystals, several bottlenecks must be addressed to screen and optimize the thousands of conditions that can lead to crystallization. In this project, we will accelerate the process of protein crystallization by detecting early, i.e. assessing nano-crystal formation and providing immediate feedback, instead of waiting for crystals to grow, thereby saving time and money. We will use nonlinear light scattering that is highly sensitive to crystal formation. In combination with machine learning analysis, we will develop optimization routines to predict the conditions that likely lead to crystallization in a very short time scale, hours, instead of weeks.
Champ scientifique
Programme(s)
Régime de financement
ERC-POC - Proof of Concept GrantInstitution d’accueil
1015 Lausanne
Suisse