Opis projektu
Ważna technika charakteryzowania białek zyskuje monitorowanie procesu w czasie rzeczywistym
Białka są jednymi z najważniejszych polimerów. Występują dosłownie we wszystkich żywych organizmach. Funkcje, które pełnią, wiążą się ściśle z ich trójwymiarową strukturą. Charakteryzowanie tych struktur ma zatem olbrzymie znaczenie w biomedycynie, detekcji środowiskowej, uzdatnianiu ścieków oraz coraz częściej w wykorzystywaniu naturalnych rozwiązań w dziedzinach od energetyki po elektronikę organiczną. Krystalografia rentgenowska jest bardzo ważną techniką pozwalającą określać położenie przestrzenne każdego atomu białka, jeśli tylko dysponujemy odpowiednio dużą jego oczyszczoną próbką, która została poddana krystalizacji. Pierwszym i najtrudniejszym krokiem jest skrystalizowanie badanego białka. Zazwyczaj zanim uzyska się pożądany efekt, trzeba przeprowadzić doświadczenia z krystalizacją w różnych warunkach. Finansowany ze środków UE projekt Fail Fast ma służyć opracowaniu metodologii, która pozwoli charakteryzować formacje nanokrystaliczne, zanim nastąpi pełny wzrost kryształu. Dzięki temu unikniemy konieczności przechodzenia przez żmudną ścieżkę prób i błędów, co pozwoli zaoszczędzić czas, pieniądze i szybciej doprowadzi nas do istotnych wyników.
Cel
High-resolution protein structures obtained by X-ray diffraction require the production of well-ordered proteins crystals of high quality. However, to produce well-ordered protein crystals, several bottlenecks must be addressed to screen and optimize the thousands of conditions that can lead to crystallization. In this project, we will accelerate the process of protein crystallization by detecting early, i.e. assessing nano-crystal formation and providing immediate feedback, instead of waiting for crystals to grow, thereby saving time and money. We will use nonlinear light scattering that is highly sensitive to crystal formation. In combination with machine learning analysis, we will develop optimization routines to predict the conditions that likely lead to crystallization in a very short time scale, hours, instead of weeks.
Dziedzina nauki
Program(-y)
System finansowania
ERC-POC - Proof of Concept GrantInstytucja przyjmująca
1015 Lausanne
Szwajcaria