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Generating monoclonal antibodies that selectively and specifically recognize epitranscriptomic modifications.

Descripción del proyecto

Tecnología novedosa para la producción de anticuerpos

Los anticuerpos contra las moléculas pequeñas se generan con métodos tradicionales que implican la conjugación con un gran portador proteico y la inyección en animales junto con un adyuvante. Sin embargo, a menudo los anticuerpos monoclonales resultantes presentan una especificidad, selectividad y sensibilidad bajas. El proyecto EPIMODKIT, financiado con fondos europeos, está trabajando en una novedosa plataforma de inmunización que produce anticuerpos altamente específicos. Con este enfoque, los científicos se centrarán en los anticuerpos contra las modificaciones epitranscriptómicas que se encuentran en los ARNm celulares, como las modificaciones de la N6-metiladenosina (m6A). Los anticuerpos de EPIMODKIT ayudarán a determinar el papel de estas modificaciones del ARNm en la salud y la enfermedad.

Objetivo

Epitranscriptomic modifications constitute specific marks in mRNA that regulate gene expression. Identification of
epitranscriptomic modifications requires next generation sequencing analyses and specific validation, processes that are cumbersome and time consuming. Furthermore, while some modifications are straightforward to identify, as they cause specific base changes (like RNA
editing), most are only detectable either through chemical means (requiring large quantities of material) or by immunoprecipitation
followed by sequencing. Of these techniques, immunoprecipitation requires far less material and can be used in any molecular
biology laboratory, but depends exquisitely on the quality of the monoclonal antibodies that recognize the modification - their
specificity, selectivity and sensitivity.
Most anti-modification antibodies are generated using traditional methods for the production of monoclonals to small
molecule haptens (e.g. conjugation to a large protein carrier and injection into animals together with an adjuvant). While these
methods can generate anti-hapten responses with some specificity they are generally not very selective. We have developed a novel
immunization platform that exquisitely focuses the antibody response to a hapten to generate high affinity monoclonals with a high
degree of specificity. We propose to employ this approach to generate anti-inosine antibodies (for the detection of editing in disease
contexts); anti-m6A antibodies (which would be benchmarked against the ones currently in use, validating our approach); and
antipseudo-uridine antibodies (a tool that is lacking in the field and for which traditional approaches have completely failed). The generation of specific and selective antibodies to these three modifications, will open the way toward a better understanding of their intricate molecular roles in biological proceGenerating monoclonal antibodies that selectively and specifically recognize epitranscriptomic modifications.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.

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Institución de acogida

DEUTSCHES KREBSFORSCHUNGSZENTRUM HEIDELBERG
Aportación neta de la UEn
€ 100 000,00
Dirección
IM NEUENHEIMER FELD 280
69120 Heidelberg
Alemania

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Región
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total
Sin datos

Beneficiarios (2)