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Generating monoclonal antibodies that selectively and specifically recognize epitranscriptomic modifications.

Description du projet

Une technologie innovante de production d’anticorps

Les anticorps contre les petites molécules sont produits à l’aide de méthodes traditionnelles qui impliquent la conjugaison à un grand transporteur de protéines et l’injection chez les animaux avec un adjuvant. Cependant, les anticorps monoclonaux qui en découlent présentent souvent de faibles spécificité, sélectivité et sensibilité. Le projet EPIMODKIT, financé par l’UE, travaille sur une plateforme innovante d’immunisation produisant des anticorps hautement spécifiques. Avec cette approche, les scientifiques se concentreront sur les anticorps contre les modifications épitranscriptomiques rencontrées chez les ARNm cellulaires, telles que les modifications N6‑méthyladénosine. Les anticorps d’EPIMODKIT aideront à définir le rôle de ces modifications de l’ARNm dans la santé et la maladie.

Objectif

Epitranscriptomic modifications constitute specific marks in mRNA that regulate gene expression. Identification of
epitranscriptomic modifications requires next generation sequencing analyses and specific validation, processes that are cumbersome and time consuming. Furthermore, while some modifications are straightforward to identify, as they cause specific base changes (like RNA
editing), most are only detectable either through chemical means (requiring large quantities of material) or by immunoprecipitation
followed by sequencing. Of these techniques, immunoprecipitation requires far less material and can be used in any molecular
biology laboratory, but depends exquisitely on the quality of the monoclonal antibodies that recognize the modification - their
specificity, selectivity and sensitivity.
Most anti-modification antibodies are generated using traditional methods for the production of monoclonals to small
molecule haptens (e.g. conjugation to a large protein carrier and injection into animals together with an adjuvant). While these
methods can generate anti-hapten responses with some specificity they are generally not very selective. We have developed a novel
immunization platform that exquisitely focuses the antibody response to a hapten to generate high affinity monoclonals with a high
degree of specificity. We propose to employ this approach to generate anti-inosine antibodies (for the detection of editing in disease
contexts); anti-m6A antibodies (which would be benchmarked against the ones currently in use, validating our approach); and
antipseudo-uridine antibodies (a tool that is lacking in the field and for which traditional approaches have completely failed). The generation of specific and selective antibodies to these three modifications, will open the way toward a better understanding of their intricate molecular roles in biological proceGenerating monoclonal antibodies that selectively and specifically recognize epitranscriptomic modifications.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Institution d’accueil

DEUTSCHES KREBSFORSCHUNGSZENTRUM HEIDELBERG
Contribution nette de l'UE
€ 100 000,00
Adresse
IM NEUENHEIMER FELD 280
69120 Heidelberg
Allemagne

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Région
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
Aucune donnée

Bénéficiaires (2)