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Single-Molecule Epigenetic Analysis of Plasma Isolated Nucleosomes for Colon Cancer Diagnostics

Descrizione del progetto

Rilevamento del cancro attraverso un esame del sangue di routine

La biopsia liquida è un approccio promettente per il rilevamento tempestivo e non invasivo del cancro. Tuttavia, i metodi attuali si basano sul sequenziamento del DNA libero e risentono dei costi elevati e di una scarsa sensibilità. Il progetto EPINuc, finanziato dall’UE, ha sviluppato una tecnologia rivoluzionaria che consente la profilazione ad alta risoluzione delle modifiche dei nucleosomi utilizzando l’imaging a singola molecola. Grazie a tale approccio, i ricercatori hanno evidenziato differenze significative nello stato epigenetico e nei livelli proteici tra individui sani e pazienti affetti da cancro del colon-retto. In seguito all’ottimizzazione, la tecnologia di EPINuc sarà commercializzata per la sua adozione nel campo della diagnosi tumorale.

Obiettivo

The analysis of cell-free DNA (cfDNA) in plasma represents a rapidly advancing field in medicine, with developing methods aiming to utilize it for diagnostics of cancer and additional pathologies. Most liquid biopsy methods are sequencing-based and provide limited information, usually relying on the detection of rare cancer-associated mutations. Therefore, they are costly and highly limited in their sensitivity. Importantly, blood cfDNA consists predominantly in the form of nucleosomes, which maintain their tissue-specific epigenetic modifications. Thus far, this rich epigenetic information has been inaccessible due to technical limitations.

We developed EPINuc, a novel single-molecule multi-parametric-based assay to comprehensively profile the Epigenetics of Plasma Isolated Nucleosomes. Our approach is based on a technology we developed (Shema et al., Science), which allows high resolution profiling of combinatorial modification states on millions of individual nucleosomes by single-molecule imaging. EPINuc is unique in its capacity to generate multi-layered information from very limited liquid biopsy material. As proof of concept, we applied it to diagnose colorectal cancer (CRC), which is one of the most common cancers worldwide, necessitating expensive and invasive screening tests for all adults older than 50. Strikingly, EPINuc revealed significant differences in the epigenetic states and protein biomarkers’ levels between healthy individuals versus CRC patients.

In this PoC, we will optimize EPINuc to generate holistic data from plasma-isolated nucleosomes that is expected to identify cancers early from a routine blood test, without the need for invasive measures. This technology has significant commercialization value for the liquid biopsy industry. We will develop a commercialization strategy and network with potential collaborators, customers and investors to spin out the innovation as a successful assay technology business.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-POC - Proof of Concept Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2020-PoC

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 150 000,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Beneficiari (1)

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