Imaging the proteome at the nanoscale

Informations projet

IMAGEOMICS

N° de convention de subvention: 964016

DOI

10.3030/964016

Projet clôturé

Date de signature de la CE 21 Decembre 2020

Date de début 1 Juillet 2021

Date de fin 31 Decembre 2024

Financé au titre de

EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Coût total

€ 3 695 981,25

Contribution de l’UE

€ 3 695 981,25

3 695 981,25

Coordonné par

UNIVERSITAETSMEDIZIN GOETTINGEN - GEORG-AUGUST-UNIVERSITAET GOETTINGEN - STIFTUNG OEFFENTLICHEN RECHTS
Germany

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Final, optimally labeled nanobodies

Final, optimally labeled nanobodies - see description of related Work Package for further details.

Final specific nanobodies

Final specific nanobodies see description of related Work Package for further details

A protocol for accurate imaging

A protocol for accurate imaging see description of related Work Package for further details

High-sensitivity assay

Highsensitivity assay see description of related Work Package for further details

X10 protocol with optimal stability

X10 protocol with optimal stability see description of related Work Package for further details

A setup capable of imaging large gels

A setup capable of imaging large gels see description of related Work Package for further details

A proof-of-principle demonstration

A proof-of-principle demonstration - see description of related Work Package for further details.

Semi-automated microscope

Semi-automated microscope - see description of related Work Package for further details.

A microfluidic application device

A microfluidic application device - see description of related Work Package for further details.

Publications

One-step nanoscale expansion microscopy reveals individual protein shapes

Auteurs: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Rajdeep Chowdhury, Jonas Altendorf, Daniel Mihaylov, Chi Zhang, Donatus Krah, Vanessa Imani, Russell K. W. Spencer, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Tiago Mimoso, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Mohamad Mahdi Alawieh, Nadia Alawar, Janna Eilts, Jinyoung Kang, Alireza Soleimani, Marcus Mül
Publié dans: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02431-9

Multi-foci parallelised RESOLFT nanoscopy in an extended field-of-view

Auteurs: Casa Moreno X, Pennacchietti F, Minet G, Damenti M, Ollech D, Barabas F, Testa I
Publié dans: Journal of Microscopy, 2023, ISSN 1365-2818
Éditeur: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.1111/jmi.13157

Affinity microfluidics enables high-throughput protein degradation analysis in cell-freeextracts

Auteurs: Brio L, Wasserman D, Michaely-Barbiro E, Barazany-Gal G, Gerber D
Publié dans: Communications Biology, 2023, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-04103-3

Heat denaturation enables multicolor X10-STED microscopy

Auteurs: Kim Ann Saal, Ali H Shaib, Nikolaos Mougios, Dagmar Crzan, Felipe Opazo, Silvio O Rizzoli
Publié dans: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-32524-5

An open-source microscopy framework for simultaneous control of image acquisition, reconstruction, and analysis

Auteurs: Casa Moreno X, Mendes Silva M, Roos J, Pennacchietti F, Norlin N, Testa I
Publié dans: Hardware X, 2023, ISSN 2468-0672
Éditeur: Elsevier B.V.
DOI: 10.1016/j.ohx.2023.e00400

Protein nanobarcodes enable single-step multiplexed fluorescence imaging

Auteurs: Daniëlle de Jong-Bolm, Mohsen Sadeghi, Guobin Bao, Gabriele Klaehn, Merle Hoff, Lucas Mittelmeier, F. Buket Basmanav, Felipe Opazo, Frank Noé, Silvio O. Rizzoli
Publié dans: 2022
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.06.03.494744

Expansion microscopy at one nanometer resolution

Auteurs: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Vanessa Imani, Rajdeep Chowdhury, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Daniel Mihaylov, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Claudia Trenkwalder, Brit Mollenhauer, Tiago F. Outeiro, Julia Preobraschenski, Ute Becherer, Tobias Moser, Edward S. Boyden, A Radu Aricescu, Markus Sauer, Felipe Opazo, Sil
Publié dans: 2022
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.03.502284

Event-triggered STED imaging

Auteurs: Jonatan Alvelid, Martina Damenti, Ilaria Testa
Publié dans: 2022
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.10.26.465907

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