Imaging the proteome at the nanoscale

Projektinformationen

IMAGEOMICS

ID Finanzhilfevereinbarung: 964016

DOI

10.3030/964016

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 21 Dezember 2020

Startdatum 1 Juli 2021

Enddatum 31 Dezember 2024

Finanziert unter

EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Gesamtkosten

€ 3 695 981,25

EU-Beitrag

€ 3 695 981,25

3 695 981,25

Koordiniert durch

UNIVERSITAETSMEDIZIN GOETTINGEN - GEORG-AUGUST-UNIVERSITAET GOETTINGEN - STIFTUNG OEFFENTLICHEN RECHTS
Germany

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Leistungen

Final, optimally labeled nanobodies

Final, optimally labeled nanobodies - see description of related Work Package for further details.

Final specific nanobodies

Final specific nanobodies see description of related Work Package for further details

A protocol for accurate imaging

A protocol for accurate imaging see description of related Work Package for further details

High-sensitivity assay

Highsensitivity assay see description of related Work Package for further details

X10 protocol with optimal stability

X10 protocol with optimal stability see description of related Work Package for further details

A setup capable of imaging large gels

A setup capable of imaging large gels see description of related Work Package for further details

A proof-of-principle demonstration

A proof-of-principle demonstration - see description of related Work Package for further details.

Semi-automated microscope

Semi-automated microscope - see description of related Work Package for further details.

A microfluidic application device

A microfluidic application device - see description of related Work Package for further details.

Veröffentlichungen

One-step nanoscale expansion microscopy reveals individual protein shapes

Autoren: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Rajdeep Chowdhury, Jonas Altendorf, Daniel Mihaylov, Chi Zhang, Donatus Krah, Vanessa Imani, Russell K. W. Spencer, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Tiago Mimoso, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Mohamad Mahdi Alawieh, Nadia Alawar, Janna Eilts, Jinyoung Kang, Alireza Soleimani, Marcus Mül
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, 2024, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02431-9

Multi-foci parallelised RESOLFT nanoscopy in an extended field-of-view

Autoren: Casa Moreno X, Pennacchietti F, Minet G, Damenti M, Ollech D, Barabas F, Testa I
Veröffentlicht in: Journal of Microscopy, 2023, ISSN 1365-2818
Herausgeber: John Wiley & Sons, Inc.
DOI: 10.1111/jmi.13157

Affinity microfluidics enables high-throughput protein degradation analysis in cell-freeextracts

Autoren: Brio L, Wasserman D, Michaely-Barbiro E, Barazany-Gal G, Gerber D
Veröffentlicht in: Communications Biology, 2023, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-04103-3

Heat denaturation enables multicolor X10-STED microscopy

Autoren: Kim Ann Saal, Ali H Shaib, Nikolaos Mougios, Dagmar Crzan, Felipe Opazo, Silvio O Rizzoli
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2023, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-32524-5

An open-source microscopy framework for simultaneous control of image acquisition, reconstruction, and analysis

Autoren: Casa Moreno X, Mendes Silva M, Roos J, Pennacchietti F, Norlin N, Testa I
Veröffentlicht in: Hardware X, 2023, ISSN 2468-0672
Herausgeber: Elsevier B.V.
DOI: 10.1016/j.ohx.2023.e00400

Protein nanobarcodes enable single-step multiplexed fluorescence imaging

Autoren: Daniëlle de Jong-Bolm, Mohsen Sadeghi, Guobin Bao, Gabriele Klaehn, Merle Hoff, Lucas Mittelmeier, F. Buket Basmanav, Felipe Opazo, Frank Noé, Silvio O. Rizzoli
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.06.03.494744

Expansion microscopy at one nanometer resolution

Autoren: Ali H. Shaib, Abed Alrahman Chouaib, Vanessa Imani, Rajdeep Chowdhury, Svilen Veselinov Georgiev, Nikolaos Mougios, Mehar Monga, Sofiia Reshetniak, Daniel Mihaylov, Han Chen, Parisa Fatehbasharzad, Dagmar Crzan, Kim-Ann Saal, Claudia Trenkwalder, Brit Mollenhauer, Tiago F. Outeiro, Julia Preobraschenski, Ute Becherer, Tobias Moser, Edward S. Boyden, A Radu Aricescu, Markus Sauer, Felipe Opazo, Sil
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.08.03.502284

Event-triggered STED imaging

Autoren: Jonatan Alvelid, Martina Damenti, Ilaria Testa
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.10.26.465907

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