Descripción del proyecto
Una plataforma innovadora para leer las proteínas
Las proteínas son unos componentes fundamentales de los organismos vivos y desempeñan un papel en todas las funciones y procesos biológicos. En el caso de una persona concreta, conocer todo el conjunto de proteínas que su organismo puede expresar (el proteoma humano) podría facilitar drásticamente el diagnóstico, el tratamiento y la prevención de la mayoría de las enfermedades humanas. Por desgracia, en la actualidad no hay métodos rentables y rápidos para ello. El proyecto ProID, financiado con fondos europeos, combinará tecnologías avanzadas para crear una plataforma tecnológica precisa, ultrasensible y ultrarrápida basada en la espectroscopia Raman mejorada. Esto permitirá registrar espectros Raman de una sola proteína con una resolución de aminoácido único a fin de permitir una identificación y una secuenciación de las proteínas rentables y rápidos.
Objetivo
The human proteome is the whole set of protein that a human can potentially express. Most of the human proteome is known. However the proteome, being the set of proteins potentially expressed, does not give information regarding the protein really expressed in a specific person or a patient. The possibility of accessing to this fundamental information through a cost and time effective technique will revolutionize our ability to prevent, diagnose and treat most of the human diseases.
This is the commitment of ProID that aims to provide a technological platform able to record single protein Raman spectra with single amino-acid resolution. Namely, by reading the sequence of selected amino-acids along the protein chain, the platform will identify the corresponding protein. To reach this goal we want to combine advanced nanofabrications of plasmonic nanopores with ultrafast time resolved photon detectors and machine learning algorithms. More in details: i) plasmonic nanopores will be exploited to achieve single amino-acid optical excitation and enhanced Raman stimulation; ii) ultrafast and ultrasensitive Raman spectrometers will be obtained by combining the emerging technologies of SPAD (Single Photon Avalanche Diode) arrays with dedicated otpica elements which improve the sensitivity and the speed of the detector, and reduce the number of elements of the array necessary to sample a Raman spectrum; iii) bioinformatics approaches will complete the technological platform by developing specific software for discriminating the Raman spectra of proteins with reduced spectral points. Also, insightful experiments on electrophoretic translocation and augmented fluid viscosity in ultra-confined systems will contribute the molecular motion into the nanopores. Finally, to state of the art in-silico design will support the project by contributing to system optimization and data analyses/interpretation.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Convocatoria de propuestas
Consulte otros proyectos de esta convocatoriaConvocatoria de subcontratación
H2020-FETOPEN-2018-2019-2020-01
Régimen de financiación
RIA - Research and Innovation actionCoordinador
16163 Genova
Italia