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Contenu archivé le 2024-06-20

Cell penetrating peptides: Modelling trans-membrane insertion

Objectif

The lipid bi-layers of biological membranes are not permeable for hydrophilic molecules under physiological conditions. However, numerous biomedical applications, such as drug delivery and gene therapy, rely on reliable way of the transmembrane translocation of proteins, fragments of DNA and other water-soluble compounds. Thus, the search for possible transduction agents continued for several decades. Cell-penetrating peptides (CPPs) are recognized to be amino acid sequences, which make an effective transduction of the hydrophilic molecules through the cell membrane possible. The transduction is claimed to be spontaneous and energy-independent process. This makes CPPs very attractive for numerous applications. Some of the CPPs are structural parts of natural proteins, while others are purely artificial or engineered sequences. Different molecular cargoes can cross the membrane being covalently bound to CPPs, which is already used in biomedical researches.

Although the CPPs are widely studied for more then a decade, their transduction mechanism is still not understood. Several possible models are proposed, however, there are no experimental techniques, which can reveal the molecular details of the translocation process and distinguish between these models. The macroscopic transduction rates of particular CPPs are of great interest for practical applications, but cannot be easily determined experimentally. Molecular dynamics simulations provide unique opportunity to study the transduction of CPPs in atomic details and to measure the transduction rates in any desirable conditions.

In the present project extensive molecular dynamics simulations of various lipid bi-layers in the presence of the cell penetrating peptides will be conducted in order to observe the event s of transduction and characterize this process in full molecular details. Transduction rates will be calculated combining the results of MD simulations with theoretical approaches.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

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Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2005-MOBILITY-7
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Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

IIF - Marie Curie actions-Incoming International Fellowships

Coordinateur

INSTITUTE OF PHYSICS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCE OF UKRAINE
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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