Obiettivo
THE TECHNIQUES OF DNA SEQUENCING ARE OF CENTRAL IMPORTANCE IN MOLECULAR BIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. DETERMINATION OF THE COMPLETE NUCLEOTIDE SEQUENCES OF LARGE MOLECULES BY THE PRESENT MANUAL METHODS, IS, HOWEVER, A TEDIOUS AND TIME CONSUMING PROCESS AS ARE THE ITERATIVE MANUAL DETERMINATIONS OF RELATIVELY SHORT SEQUENCES. THE REPETITIVE NATURE OF THE TASK MAKES IT AN IDEAL SUBJECT FOR AUTOMATION.
THE AUTOMATION OF THE PROCESS AIMED AT IN THE PRESENT PROPOSAL SHOULD SPEED UP THE DETERMINATION OF NUCLEOTIDE SEQUENCES FOR THE BENEFIT OF BOTH ACADEMIC AND INDUSTRIAL RESEARCH.
Deoxyribonucleic acid (DNA) sequencing is an obvious candidate for automation allowing more rapid access to the genetic data encoded in very large DNA molecules, such as the human genome.
Research was carried out into the production of fast and accurate instrument modules to automate aspects of sequence analysis. A novel machine was designed and built which incorporated a vision controlled robot to identify and select plaques and colonies on Petri dishes for automatic sampling and transfer of candidate material for further growth in individual containers. Electrophoresis and direct blotting were automated and a gas counter was built for directly imaging radiolabelled DNA sequences and mapping gels for genetic data abstraction.
The first robot system (APSCIR) to image mixed randomly disposed arrays of biological specimens and to pick a particular set of these for distribution into an ordered arrangement was produced. Imaging hardware and software were developed jointly with a patented robot picking head to automate this process, which is recognized as a serious bottleneck in many DNA analysis procedures. The direct blotting electrophoresis system was developed into a key technology for the second generation of automatic mappers and sequencers and the gas counter capabilities were extended into the area of sequence and genetic analysis.
AUTOMATION OF PLATING-OUT AND CULTURE INOCULATION IN DNA SEQUENCING WILL BE ACHIEVED BY FIRST CHANGING THE GEOMETRY OF THE MANUAL METHODS PRESENTLY EMPLOYED TO CONFORMATIONS WHICH ARE MORE EASILY INSTRUMENTED AND THEN IMPLEMENTING THESE AS A MACHINE VISION CONTROLLED ROBOT.
PLAQUES WILL BE DEFINED BY THEIR POSITIONAL AND VISUAL CHARACTERISTICS USING A VISION SYSTEM SENSITIVE TO SMALL COLOUR AND LOCATION CHANGES IN A POOR CONTRAST ENVIRONMENT. A HIGH RESOLUTION CCD MATRIX OR LINE CAMERA WILL BE EMPLOYED WITH BACKGROUND ILLUMINATION UNDER USER CONTROL. INTELLIGENT PATTERN RECOGNITION SOFTWARE WILL BE DEVELOPED FOR SEPARATION, CLASSIFICATION, COORDINATE COMPUTATION AND GENERATION OF OVERALL PLAQUE AND CULTURE STATISTICS. THE SYSTEM WILL BE A LOW COST, MENU DRIVEN, DEDICATED MULTI-TASKING DEVICE WITH INTERFACES TO THE MECHANICAL HANDLING ROBOT.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale visione computerizzata
- scienze naturali scienze biologiche genetica nucleotidi
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale riconoscimento delle forme
- scienze naturali scienze chimiche elettrochimica elettroforesi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Dati non disponibili
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
M60 1QD Manchester
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.