Obiettivo
BOREALIS aims to develop the resources and methodology required for genetic and physical fine-mapping of Economic Trait Loci (ETL) in cattle, a fundamental prerequisite to allow their efficient use in Marker Assisted Selection programs. The proposal is divided in four interrelated Work Packages. Work Page 1 comprises the construction of bovine large-fragment DNA libraries in YAC and PAC vectors. Both libraries will be characterised for average insert size, genome coverage and degree of chimerism. Both libraries will be stored, handled and distributed via the Reference Library Database. Each library will be freely available on request, to the scientific community. Work package 2 comprises the development of "Comparative Mapping of Anonymous Exons". The objective is to determine the homologous locus on the human gene map of an ETL of interest in cattle. The strategy is based on the predicted cross-hybridization between anonymous exons contained in bovine large insert clones isolated with microsatellite markers shown to be linked to the trait of interest. Three alternative approaches will be evaluated in a trial experiment involving wellcharacterised loci: CFTR and MHC. The most efficient method will then be applied to three specific ETL: MH, Polled and a QTL for milk production. The identification of the human homologous locus will allow the use of neighbouring human ESTs as a source of candidate genes and as conserved STSs for contig construction in cattle.
Work Package 3 consists in the generation of additional STSs specific for the three ETL of interest by chromosome-band microdissection and amplification. The chromosome-band carrying the ETL of interest will be identified by FISH using bovine large insert clones isolated with microsatellite markers linked to the trait of interest.
In Work Package 4, both types of STSs will be used jointly to screen the bovine large insert libraries and build contigs for the three ETL of interest by STS content mapping. FISH to extended chromatin fibres will be used as a complementary methodology towards contig construction.
Microsatellite markers will be isolated from these contigs and used for genetic fine-mapping of the three targeted ETLs.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione basi di dati
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze agricole scienze veterinarie e della produzione lattiero-casearia animali domestici zootecnia
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
CB2 4AT Cambridge
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.