Skip to main content
Weiter zur Homepage der Europäischen Kommission (öffnet in neuem Fenster)
Deutsch de
CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
CORDIS
Inhalt archiviert am 2024-04-30

Map refinement towards sequence ready contigs, and structure-function analysis on the short arm of chromosome 11

Ziel



Map construction will primarily be achieved by fingerprint analysis of cosmids to expand the already existing cosmid contig map (9,500 cosmids). Saturation of this map will be achieved by generation of a cosmid pocket map using complex probes generated by interspersed repetitive sequence PCR of selected llp YAC clones. Individual laboratories will focus on specific regions of llp by mapping and generating clones for these regions with fingerprint, cytogenetic, YAC and FISH techniques. The ultimate goal is a complete sequence ready map of llp. The strength of this map will be that it consists of many layers (somatic cell hybrids, YACs, cosmid contigs, FISH) and thus ensures that any errors or ambiguities that arise from cosmid fingerprinting contig assembly are seen. This makes our map very rigorous, an important asset for sequence ready cosmid contigs.

Biological studies will be performed on chromosome regions llpl3pl5. These studies will deal with the cloning of genes involved in important human genetic disorders that have already been accurately placed on the map such as lung cancer or childhood tumours at llpl3 or llpl5 respectively. Human-rodent synteny will be studied. Chromosome structure in relation to gene expression will be studied in region llpl3-pl4, a boundary of gene rich and gene-poor chromosome regions. Aniridia will be used to study the phenomenon of a position effect or a chromatin context effect (nearby translocations) on gene regulation (PAX6) as a first example in humans.

Finally, the imprinting phenomenon will be studied by isolation of genes from the imprinted region llpl5.3-pter and subsequent screening for mono-allelic expression dependent on the parental origin. Their role in diseases subject to imprinting will be analyzed. Repair studies employing human cells derived from xeroderma pigmentosum group C cells (XP-C), will be performed on these genes to test whether imprinted alleles are more sensitive to DNA damage and mutations. The repair assay will also be used to screen llpl5.3-pter for transcription activity.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

Daten nicht verfügbar

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

CSC - Cost-sharing contracts

Koordinator

Universiteit van Amsterdam
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
15,Meibergdreef
1105 AA Amsterdam
Niederlande

Auf der Karte ansehen

Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (5)

Mein Booklet 0 0